201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2684 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  44.14 
 
 		 1331 aa  813    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1242 aa  2486    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  38.48 
 
 		 1780 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  37.13 
 
 		 1215 aa  506  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.27 
 
 		 1146 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.69 
 
 		 1019 aa  349  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  28.21 
 
 		 1018 aa  278  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  32.61 
 
 		 912 aa  248  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.9 
 
 		 690 aa  230  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  25.28 
 
 		 1041 aa  212  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  27.82 
 
 		 1059 aa  194  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  27.68 
 
 		 1059 aa  192  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.03 
 
 		 1050 aa  187  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.28 
 
 		 1037 aa  183  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  26.73 
 
 		 1020 aa  161  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  25.8 
 
 		 689 aa  160  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 619 aa  159  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.46 
 
 		 1495 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  31.25 
 
 		 1478 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.28 
 
 		 697 aa  152  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  24.96 
 
 		 756 aa  141  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  29.81 
 
 		 407 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 1077 aa  126  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  28.43 
 
 		 366 aa  125  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 		 374 aa  125  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  57.55 
 
 		 1577 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  29.57 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  28.68 
 
 		 520 aa  118  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.15 
 
 		 2457 aa  115  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 323 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  28.19 
 
 		 359 aa  111  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  28.35 
 
 		 331 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  28.9 
 
 		 371 aa  107  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  28.18 
 
 		 333 aa  107  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.85 
 
 		 423 aa  106  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  28.27 
 
 		 338 aa  106  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  26.43 
 
 		 321 aa  106  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  28.33 
 
 		 328 aa  101  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  27.63 
 
 		 347 aa  100  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 317 aa  100  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  26.27 
 
 		 347 aa  98.2  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  27.15 
 
 		 324 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 837 aa  96.3  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  28.37 
 
 		 399 aa  95.1  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  29.75 
 
 		 491 aa  94.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  49.5 
 
 		 1260 aa  93.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  26.41 
 
 		 382 aa  93.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 		 373 aa  92.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  27.62 
 
 		 488 aa  92.8  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  28.94 
 
 		 477 aa  92  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  27.84 
 
 		 394 aa  89  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  28.13 
 
 		 543 aa  87.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  26.78 
 
 		 495 aa  87  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.22 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.74 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  27.59 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  24.6 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  27.84 
 
 		 829 aa  84.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  28.61 
 
 		 474 aa  84.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  24.57 
 
 		 423 aa  84.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.06 
 
 		 457 aa  84  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.63 
 
 		 398 aa  83.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  27.84 
 
 		 619 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  24.86 
 
 		 364 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  31.84 
 
 		 215 aa  80.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  23.99 
 
 		 820 aa  79  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.58 
 
 		 2286 aa  79  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  25.82 
 
 		 474 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  35.25 
 
 		 393 aa  77.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  27.49 
 
 		 383 aa  77.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  27.14 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  26.69 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.13 
 
 		 669 aa  74.3  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  23.96 
 
 		 387 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.93 
 
 		 309 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  25.78 
 
 		 756 aa  73.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  26.8 
 
 		 487 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  25.57 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  24.78 
 
 		 1001 aa  70.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  35.59 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  40.21 
 
 		 443 aa  67.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  24.12 
 
 		 463 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 368 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  24.02 
 
 		 778 aa  67.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  23.27 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  25.24 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  42.39 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  27.43 
 
 		 373 aa  64.3  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  26.21 
 
 		 457 aa  64.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  25.42 
 
 		 451 aa  64.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  26.71 
 
 		 451 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.62 
 
 		 623 aa  63.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.42 
 
 		 490 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.79 
 
 		 401 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>