259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1857 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.39 
 
 		 979 aa  799    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.92 
 
 		 984 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  63.05 
 
 		 785 aa  828    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  57.86 
 
 		 973 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 1478 aa  3034    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  54.16 
 
 		 974 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  57.41 
 
 		 1121 aa  733    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  56.92 
 
 		 900 aa  753    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  98.95 
 
 		 1759 aa  1917    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.41 
 
 		 938 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  63.73 
 
 		 741 aa  820    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 		 966 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  56.01 
 
 		 894 aa  724    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  58.09 
 
 		 842 aa  773    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  99.88 
 
 		 1904 aa  1613    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  56.51 
 
 		 963 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  60.68 
 
 		 854 aa  844    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  65.54 
 
 		 919 aa  907    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  55.79 
 
 		 854 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  62.98 
 
 		 722 aa  869    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  87.42 
 
 		 1414 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  88.56 
 
 		 1294 aa  602  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  93.73 
 
 		 1369 aa  603  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  64.9 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  65.47 
 
 		 1037 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  58.94 
 
 		 1041 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  61.06 
 
 		 1059 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  61.06 
 
 		 1059 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  55.23 
 
 		 689 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  52.19 
 
 		 1020 aa  365  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  51.35 
 
 		 323 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  44.74 
 
 		 331 aa  324  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  44.83 
 
 		 366 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  99.35 
 
 		 833 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 		 678 aa  281  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  46.13 
 
 		 359 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  41.72 
 
 		 1019 aa  276  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  43.71 
 
 		 423 aa  273  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  43.03 
 
 		 321 aa  268  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  43.12 
 
 		 324 aa  268  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  40.57 
 
 		 374 aa  264  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  40.77 
 
 		 338 aa  261  6e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  40.05 
 
 		 407 aa  259  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  39.83 
 
 		 1018 aa  249  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  38.14 
 
 		 337 aa  238  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 619 aa  228  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  42.28 
 
 		 347 aa  228  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  37.28 
 
 		 756 aa  225  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  41.61 
 
 		 347 aa  224  6e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  38.61 
 
 		 690 aa  221  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  40.12 
 
 		 371 aa  220  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.69 
 
 		 423 aa  212  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 		 382 aa  207  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  37.82 
 
 		 1077 aa  207  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.66 
 
 		 333 aa  207  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.43 
 
 		 491 aa  206  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 837 aa  206  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  37.8 
 
 		 474 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  35.17 
 
 		 1780 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.28 
 
 		 328 aa  199  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  37.11 
 
 		 1050 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  34.18 
 
 		 369 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  39.16 
 
 		 488 aa  195  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  38.72 
 
 		 364 aa  194  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  37.39 
 
 		 619 aa  193  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.54 
 
 		 628 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  33.07 
 
 		 912 aa  193  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.88 
 
 		 1146 aa  190  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  36.73 
 
 		 2457 aa  189  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  38.87 
 
 		 457 aa  189  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  33.99 
 
 		 370 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  35.05 
 
 		 376 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.89 
 
 		 658 aa  185  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  36.3 
 
 		 399 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.45 
 
 		 495 aa  184  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  36.04 
 
 		 463 aa  184  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  37.05 
 
 		 815 aa  184  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  33.69 
 
 		 1495 aa  184  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  35.51 
 
 		 503 aa  183  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  33.51 
 
 		 806 aa  183  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  35.28 
 
 		 477 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  34.83 
 
 		 1331 aa  182  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  36.25 
 
 		 474 aa  180  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.49 
 
 		 497 aa  180  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  36.62 
 
 		 543 aa  180  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  34.95 
 
 		 317 aa  179  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  35.8 
 
 		 756 aa  177  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.46 
 
 		 383 aa  175  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  33.42 
 
 		 1215 aa  173  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  34.58 
 
 		 829 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  36.34 
 
 		 820 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 		 394 aa  172  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  36.02 
 
 		 1001 aa  172  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 472 aa  171  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.43 
 
 		 490 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 		 778 aa  170  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 373 aa  170  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.69 
 
 		 451 aa  169  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.21 
 
 		 887 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.84 
 
 		 398 aa  166  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>