171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0624 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  69.31 
 
 		 619 aa  776    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 756 aa  1546    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  35.93 
 
 		 1077 aa  321  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  37.55 
 
 		 1059 aa  319  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  37.55 
 
 		 1059 aa  319  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.21 
 
 		 697 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.85 
 
 		 1041 aa  288  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  34.82 
 
 		 1037 aa  283  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.8 
 
 		 1020 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.54 
 
 		 1018 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  30.06 
 
 		 1019 aa  243  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  30.63 
 
 		 689 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 		 912 aa  224  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  37.77 
 
 		 1478 aa  223  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.57 
 
 		 1050 aa  213  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.04 
 
 		 366 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29 
 
 		 1495 aa  201  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  29.89 
 
 		 1780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  32.97 
 
 		 331 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.91 
 
 		 1146 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.7 
 
 		 323 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  33.69 
 
 		 337 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  28.88 
 
 		 1215 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  36.24 
 
 		 520 aa  185  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  32.83 
 
 		 359 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 1331 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.85 
 
 		 806 aa  180  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.88 
 
 		 338 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  31.36 
 
 		 324 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.98 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 347 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  27.15 
 
 		 690 aa  161  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  33.74 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  32.69 
 
 		 474 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  28.07 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  31.85 
 
 		 815 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 837 aa  157  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  29.55 
 
 		 374 aa  154  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.12 
 
 		 423 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  30.99 
 
 		 820 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  28.92 
 
 		 371 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  29.97 
 
 		 497 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.45 
 
 		 495 aa  147  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  29.34 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  32.25 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  30.41 
 
 		 1001 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 370 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 		 472 aa  140  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.67 
 
 		 829 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  30.38 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 328 aa  138  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  24.53 
 
 		 1242 aa  138  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 628 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  28.45 
 
 		 474 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  30.5 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.48 
 
 		 1186 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  31.37 
 
 		 756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  28.72 
 
 		 369 aa  134  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 		 2457 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.23 
 
 		 490 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  29.6 
 
 		 543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.41 
 
 		 778 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 454 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  30.39 
 
 		 317 aa  129  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  26.39 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 		 463 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 678 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  29.31 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  32.73 
 
 		 333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 		 364 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.46 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  30.1 
 
 		 477 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.53 
 
 		 487 aa  121  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.24 
 
 		 389 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  27.18 
 
 		 503 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  30.11 
 
 		 309 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.96 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 376 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.34 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.08 
 
 		 770 aa  111  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.51 
 
 		 373 aa  111  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  24.79 
 
 		 399 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  26.89 
 
 		 465 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  27.34 
 
 		 619 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  28.93 
 
 		 401 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  26.32 
 
 		 383 aa  99  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  25.87 
 
 		 394 aa  97.8  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  25.7 
 
 		 387 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  27.24 
 
 		 486 aa  97.4  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  27.3 
 
 		 381 aa  95.5  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  25.34 
 
 		 373 aa  94.4  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  26.6 
 
 		 375 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  23.49 
 
 		 392 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  30.49 
 
 		 370 aa  92  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  25.99 
 
 		 388 aa  90.9  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  26.55 
 
 		 541 aa  88.6  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 368 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  25.07 
 
 		 357 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>