More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4414 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 487 aa  994    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  75.42 
 
 		 490 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  65.59 
 
 		 678 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  67.29 
 
 		 778 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  50.57 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  48.17 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  49.31 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.6 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.42 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  39.8 
 
 		 503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  45.86 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  39.45 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  40.09 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  38.44 
 
 		 829 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  42.94 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.24 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  39.88 
 
 		 373 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  37.56 
 
 		 756 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  42.81 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  37.93 
 
 		 628 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  37.58 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  38.24 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  37.7 
 
 		 820 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  39.17 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  38.58 
 
 		 347 aa  259  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  37.82 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.66 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.67 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  40.37 
 
 		 837 aa  256  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  41.81 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  35.78 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  43.03 
 
 		 309 aa  249  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  41.54 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.63 
 
 		 815 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  41.9 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  41.45 
 
 		 321 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  38.6 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.05 
 
 		 1001 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  39.45 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  40.99 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  41.81 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  39.68 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  35.35 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  36.28 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  36.2 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  34.86 
 
 		 366 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.58 
 
 		 328 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  38.18 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  32.38 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  35.09 
 
 		 317 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 697 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.43 
 
 		 689 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  34.52 
 
 		 359 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  36.52 
 
 		 1019 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  33.93 
 
 		 1037 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.79 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  33.24 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  33.64 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  32.1 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  33.56 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.33 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  32.81 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  33.65 
 
 		 1041 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  33.04 
 
 		 369 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  32.32 
 
 		 1478 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.84 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  32.35 
 
 		 381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.73 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  37.23 
 
 		 619 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.58 
 
 		 1050 aa  160  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  32.24 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.74 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  28.86 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.29 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.56 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 1059 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 1059 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  33.54 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.25 
 
 		 690 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.48 
 
 		 770 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  29.47 
 
 		 321 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  31.86 
 
 		 1018 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.8 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  29.5 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.17 
 
 		 1020 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.43 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  66 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.78 
 
 		 1495 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.57 
 
 		 806 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.52 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.45 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  60.58 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  28.66 
 
 		 912 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  29.33 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  28.53 
 
 		 674 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.38 
 
 		 1146 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 1077 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>