161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1715 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  48.93 
 
 		 1059 aa  956    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  50.3 
 
 		 1041 aa  990    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  48.83 
 
 		 1059 aa  955    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  45.25 
 
 		 1020 aa  865    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1037 aa  2127    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.94 
 
 		 697 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  43.13 
 
 		 689 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.69 
 
 		 1018 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 		 1019 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  65.47 
 
 		 1478 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.68 
 
 		 1780 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  51.05 
 
 		 366 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30.32 
 
 		 1050 aa  340  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  31.94 
 
 		 912 aa  337  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.76 
 
 		 1146 aa  335  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  51.37 
 
 		 323 aa  332  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  27.42 
 
 		 1215 aa  326  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  45.86 
 
 		 331 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  46.4 
 
 		 374 aa  310  8e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  48.8 
 
 		 359 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  27.22 
 
 		 1331 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  35.19 
 
 		 690 aa  304  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  47.22 
 
 		 324 aa  300  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  44.35 
 
 		 407 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  44.61 
 
 		 338 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  42.21 
 
 		 423 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  34.35 
 
 		 756 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  44.38 
 
 		 321 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  43.29 
 
 		 337 aa  259  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  42.72 
 
 		 382 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 		 1495 aa  244  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  42.61 
 
 		 347 aa  232  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  41.92 
 
 		 347 aa  229  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  42.39 
 
 		 333 aa  227  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  38.35 
 
 		 369 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  41.64 
 
 		 371 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  38.92 
 
 		 837 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  36.02 
 
 		 370 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  40.69 
 
 		 457 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 1077 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  39.35 
 
 		 491 aa  209  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  35.47 
 
 		 2457 aa  201  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  36.33 
 
 		 815 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  32.58 
 
 		 806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.5 
 
 		 497 aa  199  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  39.39 
 
 		 376 aa  199  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.24 
 
 		 474 aa  197  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  37.29 
 
 		 328 aa  197  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  36.33 
 
 		 423 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  43.23 
 
 		 488 aa  191  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  38.02 
 
 		 474 aa  191  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  37.42 
 
 		 399 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  37.23 
 
 		 477 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.12 
 
 		 619 aa  188  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  36.74 
 
 		 820 aa  187  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  38.75 
 
 		 503 aa  187  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  36.33 
 
 		 1001 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  33.94 
 
 		 373 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 		 495 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.74 
 
 		 465 aa  181  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 454 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  36.92 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  35.69 
 
 		 472 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  36.74 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 389 aa  179  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  38.46 
 
 		 451 aa  179  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  35.86 
 
 		 317 aa  178  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  47.92 
 
 		 215 aa  178  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  36.99 
 
 		 383 aa  178  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.05 
 
 		 756 aa  178  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  35.28 
 
 		 678 aa  178  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.41 
 
 		 394 aa  177  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  33.93 
 
 		 487 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  28 
 
 		 1242 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.08 
 
 		 451 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.14 
 
 		 375 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  36.77 
 
 		 457 aa  172  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.98 
 
 		 490 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  35.71 
 
 		 829 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.95 
 
 		 778 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  36.97 
 
 		 309 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  36.72 
 
 		 364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  34.71 
 
 		 370 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 		 628 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  35.69 
 
 		 368 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  32.8 
 
 		 387 aa  161  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  32.94 
 
 		 373 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 388 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  34.74 
 
 		 370 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 401 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 392 aa  155  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1702  Carbohydrate-binding CenC domain protein  41.46 
 
 		 224 aa  151  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  32.2 
 
 		 486 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.68 
 
 		 463 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  32.02 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  34.1 
 
 		 770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.51 
 
 		 357 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.33 
 
 		 561 aa  147  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  32.4 
 
 		 357 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>