36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0643 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  54.08 
 
 		 1020 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  52.55 
 
 		 1059 aa  203  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  52.04 
 
 		 1059 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  52.94 
 
 		 1041 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  47.92 
 
 		 1037 aa  178  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  41.85 
 
 		 1018 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  39.67 
 
 		 1050 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  38.5 
 
 		 1215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  37.63 
 
 		 1495 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  38.57 
 
 		 1780 aa  124  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  35.15 
 
 		 2286 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  39.13 
 
 		 691 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  36.92 
 
 		 1331 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.91 
 
 		 1146 aa  114  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  30.6 
 
 		 1748 aa  92  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  33.69 
 
 		 1160 aa  92  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 		 1019 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  31.02 
 
 		 1585 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.02 
 
 		 1247 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  31.02 
 
 		 1474 aa  88.2  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  31.02 
 
 		 1217 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  31.5 
 
 		 1223 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.48 
 
 		 1002 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  29.52 
 
 		 1275 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  31.84 
 
 		 1242 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  30.94 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  26.09 
 
 		 1418 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.27 
 
 		 1657 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  26.47 
 
 		 626 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  24.18 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  26.32 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0374  Carbohydrate-binding family 9  26.07 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  25.59 
 
 		 1141 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03943  hypothetical protein  23.15 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>