136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0639 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  65.97 
 
 		 1780 aa  1122    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1215 aa  2402    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  48.02 
 
 		 1331 aa  843    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.65 
 
 		 1146 aa  754    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  39.4 
 
 		 1019 aa  506  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  38.98 
 
 		 1242 aa  503  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.98 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.24 
 
 		 1059 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.14 
 
 		 1059 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 		 1020 aa  351  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  31.07 
 
 		 1041 aa  347  6e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  41.99 
 
 		 690 aa  340  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  27.42 
 
 		 1037 aa  333  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  34.88 
 
 		 912 aa  318  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.87 
 
 		 1050 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.78 
 
 		 697 aa  227  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.62 
 
 		 1495 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  28.47 
 
 		 689 aa  193  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 		 756 aa  192  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 619 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.64 
 
 		 331 aa  180  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.33 
 
 		 1478 aa  178  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.7 
 
 		 366 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  31.84 
 
 		 324 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 		 407 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  31.83 
 
 		 323 aa  158  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.97 
 
 		 321 aa  157  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.52 
 
 		 359 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  31.64 
 
 		 337 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  38.36 
 
 		 328 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.15 
 
 		 338 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.19 
 
 		 374 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.05 
 
 		 474 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  31.71 
 
 		 477 aa  132  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.2 
 
 		 488 aa  131  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  32.75 
 
 		 371 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  33.82 
 
 		 543 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  30.96 
 
 		 423 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 1077 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  38.5 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.17 
 
 		 423 aa  128  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  33.33 
 
 		 491 aa  128  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  30.64 
 
 		 778 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 		 2457 aa  121  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 837 aa  121  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 		 628 aa  121  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 815 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  27.61 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  30.45 
 
 		 487 aa  118  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.23 
 
 		 347 aa  116  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  33.03 
 
 		 399 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.93 
 
 		 347 aa  115  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  32.31 
 
 		 398 aa  115  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 678 aa  115  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  37.93 
 
 		 691 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  31.09 
 
 		 474 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  28.65 
 
 		 490 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.38 
 
 		 497 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  30.35 
 
 		 373 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  30.9 
 
 		 388 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 		 333 aa  112  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  24.8 
 
 		 806 aa  112  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  31.55 
 
 		 820 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 451 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  32.01 
 
 		 1001 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  33.33 
 
 		 383 aa  110  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 619 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 382 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  30.28 
 
 		 503 aa  108  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  30.24 
 
 		 376 aa  106  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  25.76 
 
 		 364 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 495 aa  104  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.6 
 
 		 520 aa  104  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 		 370 aa  104  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  31.28 
 
 		 472 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  31.93 
 
 		 394 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 457 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.27 
 
 		 829 aa  102  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.44 
 
 		 317 aa  102  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.47 
 
 		 454 aa  101  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.31 
 
 		 457 aa  100  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.86 
 
 		 756 aa  99.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.8 
 
 		 639 aa  95.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  30.38 
 
 		 451 aa  95.5  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.61 
 
 		 309 aa  92.8  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  31.68 
 
 		 370 aa  92.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  28.01 
 
 		 498 aa  89.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  26.1 
 
 		 463 aa  87.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  26.06 
 
 		 357 aa  87.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.2 
 
 		 2286 aa  86.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1525  hypothetical protein  39.66 
 
 		 2235 aa  85.1  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.93 
 
 		 389 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  25.88 
 
 		 486 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  36.43 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  24.41 
 
 		 387 aa  81.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30.81 
 
 		 1275 aa  79.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  28.71 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.14 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 368 aa  78.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 		 770 aa  75.1  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>