152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1648 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 1146 aa  2281    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  53 
 
 		 1780 aa  849    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  47.79 
 
 		 1331 aa  804    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  45.76 
 
 		 1215 aa  739    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  38.35 
 
 		 1019 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  36.97 
 
 		 1242 aa  479  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 		 1018 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.65 
 
 		 1037 aa  337  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  29.21 
 
 		 1059 aa  336  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  29.21 
 
 		 1059 aa  336  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28.45 
 
 		 1020 aa  326  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  34.03 
 
 		 912 aa  322  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 1041 aa  318  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  36.9 
 
 		 690 aa  308  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30 
 
 		 1050 aa  212  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.03 
 
 		 1495 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  25.91 
 
 		 689 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.74 
 
 		 697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 		 756 aa  193  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 619 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.88 
 
 		 1478 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.8 
 
 		 366 aa  184  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 		 331 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.66 
 
 		 407 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  31.99 
 
 		 337 aa  168  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.24 
 
 		 359 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  31.73 
 
 		 323 aa  162  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  34.91 
 
 		 491 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 		 371 aa  148  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  31.04 
 
 		 324 aa  146  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 		 1077 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  35.12 
 
 		 543 aa  144  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  30.73 
 
 		 338 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  35.37 
 
 		 328 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  32.59 
 
 		 477 aa  142  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  29.24 
 
 		 321 aa  140  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.8 
 
 		 488 aa  139  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  31.65 
 
 		 423 aa  138  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  29.18 
 
 		 423 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  32.64 
 
 		 399 aa  134  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  32.22 
 
 		 474 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.48 
 
 		 347 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  29.75 
 
 		 374 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  28.18 
 
 		 347 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  33.03 
 
 		 383 aa  131  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  31.52 
 
 		 778 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  29.14 
 
 		 373 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 815 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 		 628 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 		 520 aa  128  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  30.4 
 
 		 619 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  25.32 
 
 		 806 aa  126  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.26 
 
 		 2457 aa  125  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  30.95 
 
 		 333 aa  125  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  33.94 
 
 		 398 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 678 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  30.77 
 
 		 503 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  29.91 
 
 		 309 aa  121  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 382 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  30.48 
 
 		 487 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 837 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  31.27 
 
 		 1001 aa  118  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.04 
 
 		 497 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.98 
 
 		 457 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  30.63 
 
 		 495 aa  116  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.08 
 
 		 317 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  30.3 
 
 		 394 aa  115  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  37.91 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  30.89 
 
 		 376 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  29.73 
 
 		 829 aa  111  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  28.69 
 
 		 463 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  30.84 
 
 		 474 aa  110  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  26.3 
 
 		 364 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 454 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  26.81 
 
 		 490 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  28.97 
 
 		 357 aa  105  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  29.06 
 
 		 388 aa  105  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.65 
 
 		 472 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  25.21 
 
 		 369 aa  103  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  27.78 
 
 		 387 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  27.44 
 
 		 457 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  28.12 
 
 		 820 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 451 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  32.73 
 
 		 451 aa  99  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.48 
 
 		 756 aa  98.2  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  32.02 
 
 		 691 aa  97.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  29.04 
 
 		 357 aa  96.3  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  24.93 
 
 		 370 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  28.18 
 
 		 389 aa  94.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  27.46 
 
 		 486 aa  92.8  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  28.78 
 
 		 375 aa  93.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.88 
 
 		 357 aa  92.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  26.09 
 
 		 465 aa  90.1  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 		 368 aa  89.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  30.73 
 
 		 2286 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  27.94 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  26.58 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  26.18 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  30.34 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>