225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2683 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.59 
 
 		 1146 aa  802    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  48.02 
 
 		 1215 aa  831    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  55.24 
 
 		 1780 aa  893    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  46.67 
 
 		 1242 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 1331 aa  2637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  40.45 
 
 		 1019 aa  525  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.2 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  28.95 
 
 		 1041 aa  325  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  40.15 
 
 		 690 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  35.01 
 
 		 912 aa  308  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  27.22 
 
 		 1037 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  27.77 
 
 		 1059 aa  303  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  27.88 
 
 		 1059 aa  301  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.84 
 
 		 1020 aa  227  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  29.85 
 
 		 1050 aa  213  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.08 
 
 		 1495 aa  210  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.24 
 
 		 697 aa  206  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.68 
 
 		 689 aa  193  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.86 
 
 		 366 aa  191  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.32 
 
 		 756 aa  178  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.71 
 
 		 1478 aa  178  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 619 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  31.58 
 
 		 331 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  34.49 
 
 		 407 aa  164  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.08 
 
 		 337 aa  163  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  33.04 
 
 		 324 aa  163  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 323 aa  162  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 		 321 aa  162  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.81 
 
 		 359 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  32.45 
 
 		 338 aa  148  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  34.35 
 
 		 371 aa  148  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  32.25 
 
 		 423 aa  147  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  35.62 
 
 		 477 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 1077 aa  140  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.01 
 
 		 491 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 815 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 837 aa  135  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  29.95 
 
 		 374 aa  133  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.21 
 
 		 488 aa  133  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  31.48 
 
 		 2457 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  32.34 
 
 		 309 aa  131  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  35.29 
 
 		 543 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 		 328 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 		 678 aa  129  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 347 aa  128  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  47.17 
 
 		 1577 aa  128  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  33.33 
 
 		 474 aa  127  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  31.82 
 
 		 778 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  32.7 
 
 		 1001 aa  127  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  29.97 
 
 		 347 aa  126  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  34.6 
 
 		 333 aa  125  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.15 
 
 		 497 aa  125  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 		 628 aa  125  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  34.39 
 
 		 399 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  30.25 
 
 		 423 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  30.79 
 
 		 503 aa  122  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  33.94 
 
 		 394 aa  121  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.93 
 
 		 495 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  31.78 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 		 382 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  32.62 
 
 		 457 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.05 
 
 		 806 aa  119  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 		 388 aa  119  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  32.03 
 
 		 487 aa  118  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 		 398 aa  118  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  31.07 
 
 		 820 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.41 
 
 		 474 aa  117  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  36.92 
 
 		 215 aa  115  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  34.47 
 
 		 829 aa  115  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  28.37 
 
 		 369 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.64 
 
 		 317 aa  113  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  32.19 
 
 		 383 aa  112  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  28.53 
 
 		 520 aa  111  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.41 
 
 		 490 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 		 454 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  26.25 
 
 		 364 aa  111  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  31.79 
 
 		 472 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  31.92 
 
 		 451 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  32.09 
 
 		 376 aa  109  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.73 
 
 		 370 aa  108  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  29.5 
 
 		 691 aa  107  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  31.58 
 
 		 756 aa  107  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1525  hypothetical protein  40.11 
 
 		 2235 aa  106  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  32.69 
 
 		 457 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  32.67 
 
 		 451 aa  102  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  27.35 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  26.9 
 
 		 463 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  26.28 
 
 		 387 aa  92.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  28.83 
 
 		 389 aa  90.9  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.57 
 
 		 375 aa  89  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  47.06 
 
 		 1260 aa  88.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  22.75 
 
 		 1247 aa  85.5  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  28.9 
 
 		 370 aa  84.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.52 
 
 		 2286 aa  82.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  27.95 
 
 		 401 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 368 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  27.05 
 
 		 541 aa  80.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  35.25 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  26.5 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>