135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1074 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 498 aa  1009    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  36.75 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  37.28 
 
 		 606 aa  237  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  35.62 
 
 		 670 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  38.59 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  32.05 
 
 		 975 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 		 639 aa  209  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  32.43 
 
 		 831 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  33.63 
 
 		 674 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  33.41 
 
 		 748 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  31.81 
 
 		 760 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  29.1 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  28.09 
 
 		 1014 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.58 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.45 
 
 		 497 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  26.23 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  28.77 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  27.95 
 
 		 371 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  25.97 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  29.88 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  27.11 
 
 		 366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  27.85 
 
 		 383 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  29.24 
 
 		 820 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  27.88 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  27.66 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 628 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  28.44 
 
 		 398 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  26.07 
 
 		 433 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.46 
 
 		 778 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  31.96 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  28.99 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.97 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  30.83 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.08 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  27.21 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.14 
 
 		 756 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 837 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  34.36 
 
 		 376 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.55 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  28.62 
 
 		 347 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  26.07 
 
 		 574 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.43 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 678 aa  97.4  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  26.63 
 
 		 428 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 		 375 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  26.97 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  28.04 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  29.33 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.03 
 
 		 829 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  27.21 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  25.85 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  28.41 
 
 		 1478 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  28.78 
 
 		 495 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  26.65 
 
 		 1018 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.84 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  26.73 
 
 		 689 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  29.3 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  28.37 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  29.3 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  28.37 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  26.69 
 
 		 359 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.66 
 
 		 474 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  24.51 
 
 		 374 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  30.22 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  31.68 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  26.1 
 
 		 815 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  30.04 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  27.04 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.63 
 
 		 697 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  25.37 
 
 		 465 aa  87.4  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.68 
 
 		 309 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  24.24 
 
 		 1041 aa  86.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  28.94 
 
 		 373 aa  86.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  28.96 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  27.84 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.73 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  26.35 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  29.62 
 
 		 1780 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  27.47 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.8 
 
 		 1019 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  27.82 
 
 		 1001 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  28.01 
 
 		 1215 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  32.2 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  25.6 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  24.72 
 
 		 1037 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  24.79 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  28.63 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  33.99 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 368 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  25.55 
 
 		 357 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  30.11 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.94 
 
 		 1146 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  27.09 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 		 1331 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  24.92 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  25.59 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>