143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0988 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 975 aa  1982    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  40.45 
 
 		 831 aa  313  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  39.81 
 
 		 748 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  37.96 
 
 		 482 aa  290  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  59.38 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  30.68 
 
 		 670 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  32.05 
 
 		 498 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 		 606 aa  187  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 639 aa  164  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.1 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  27.55 
 
 		 434 aa  154  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 760 aa  141  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 417 aa  119  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  22.57 
 
 		 457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 451 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 		 1014 aa  94  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  23.27 
 
 		 415 aa  93.2  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  23.34 
 
 		 408 aa  89.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  24.83 
 
 		 433 aa  88.2  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 837 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  22.6 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  24.71 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  22.48 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  23.04 
 
 		 428 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  26.77 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  23.44 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  66 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  24.56 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  25.14 
 
 		 328 aa  70.5  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  24.35 
 
 		 829 aa  70.1  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  23.85 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  24.71 
 
 		 333 aa  70.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  45.95 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  22.86 
 
 		 543 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  23.58 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.28 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  24.3 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  25.07 
 
 		 491 aa  67.4  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  24.18 
 
 		 1018 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  24.84 
 
 		 347 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  21.62 
 
 		 398 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  23.9 
 
 		 347 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  22.01 
 
 		 376 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  22.91 
 
 		 1495 aa  63.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  20.37 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  22.39 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  23.05 
 
 		 1001 aa  62.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  23.05 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  22.53 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  22.71 
 
 		 756 aa  62  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  41.89 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  23.05 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  22.49 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  22.92 
 
 		 383 aa  60.1  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  45.83 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  23.33 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  22.05 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  26.16 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  21.79 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  40.54 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  44.12 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  24.38 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  23.95 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  21.86 
 
 		 389 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 		 628 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  33.1 
 
 		 1780 aa  57.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  23.44 
 
 		 338 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.67 
 
 		 930 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  22.8 
 
 		 451 aa  57.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  37.14 
 
 		 831 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.03 
 
 		 547 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.97 
 
 		 1414 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.61 
 
 		 1146 aa  56.2  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  24.04 
 
 		 1242 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  24.11 
 
 		 689 aa  55.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  21.24 
 
 		 433 aa  55.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  23.19 
 
 		 474 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  35.06 
 
 		 735 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  37.33 
 
 		 668 aa  55.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  23.4 
 
 		 375 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  23.73 
 
 		 465 aa  55.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  36.62 
 
 		 581 aa  55.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  24.48 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  36.62 
 
 		 294 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  40 
 
 		 361 aa  53.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  22.52 
 
 		 370 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  23.12 
 
 		 309 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  25.29 
 
 		 1331 aa  53.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  36.62 
 
 		 298 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  36 
 
 		 387 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  35.21 
 
 		 709 aa  53.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  39.73 
 
 		 389 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  22.26 
 
 		 357 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.48 
 
 		 1186 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  22.56 
 
 		 678 aa  52  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  22.22 
 
 		 423 aa  51.6  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  36.62 
 
 		 919 aa  52  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  38.16 
 
 		 848 aa  51.6  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>