56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0737 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  70.65 
 
 
298 aa  408  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  56.95 
 
 
586 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  58 
 
 
877 aa  238  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1027  argininosuccinate synthase  45.8 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0529308  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  43.81 
 
 
627 aa  175  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1029  hypothetical protein  39.27 
 
 
254 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.785659  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2188  hypothetical protein  39.5 
 
 
1103 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1717  amino acid carrier protein  34.82 
 
 
2772 aa  116  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.954872  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1718  hypothetical protein  33.07 
 
 
965 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  72.86 
 
 
579 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  64.1 
 
 
919 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  70.59 
 
 
739 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  69.44 
 
 
391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  65.28 
 
 
787 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  68.57 
 
 
930 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  68.57 
 
 
668 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  65.71 
 
 
735 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  67.14 
 
 
627 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  67.14 
 
 
387 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  57.89 
 
 
581 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  68.12 
 
 
676 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  68.66 
 
 
522 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  66.67 
 
 
831 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  62.5 
 
 
848 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  64.29 
 
 
958 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  64 
 
 
709 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  62.86 
 
 
869 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  64.29 
 
 
749 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  50.59 
 
 
403 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  66.67 
 
 
561 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  67.65 
 
 
488 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  56.98 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  59.46 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  66.18 
 
 
343 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  59.42 
 
 
522 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  56.94 
 
 
389 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  61.19 
 
 
433 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  52.17 
 
 
479 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  58.33 
 
 
697 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  57.53 
 
 
468 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  53.57 
 
 
698 aa  90.5  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.78 
 
 
547 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  47.13 
 
 
110 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  46.67 
 
 
479 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  50 
 
 
1056 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  47.06 
 
 
884 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  47.14 
 
 
883 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  49.15 
 
 
595 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  41.33 
 
 
528 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  41.77 
 
 
887 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.88 
 
 
594 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  40.98 
 
 
472 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  36.62 
 
 
975 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.96 
 
 
1531 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  42.11 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>