164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2391 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  77.03 
 
 		 831 aa  877    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 748 aa  1490    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  68.36 
 
 		 703 aa  320  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  39.91 
 
 		 975 aa  318  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  41.69 
 
 		 482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  59.41 
 
 		 1004 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  63.98 
 
 		 984 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  54.3 
 
 		 1221 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  57.53 
 
 		 1050 aa  278  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  84.25 
 
 		 507 aa  247  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  31.99 
 
 		 498 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  48.46 
 
 		 651 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  28.54 
 
 		 670 aa  168  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 606 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.56 
 
 		 674 aa  151  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  29.06 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 417 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  51.75 
 
 		 611 aa  131  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  49.34 
 
 		 768 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  23.33 
 
 		 760 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  21.16 
 
 		 457 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 451 aa  103  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  25.72 
 
 		 433 aa  88.6  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  24.19 
 
 		 415 aa  87.8  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  25.7 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  25.67 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  22.7 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  23.37 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  25.93 
 
 		 1018 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  25.83 
 
 		 1050 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  27.22 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  25.55 
 
 		 1495 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  23.98 
 
 		 497 aa  72  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  24.27 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  20.84 
 
 		 1014 aa  71.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  24.01 
 
 		 333 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  26.3 
 
 		 1001 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  24.46 
 
 		 756 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  25.62 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.29 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.46 
 
 		 820 aa  67.4  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  23.15 
 
 		 371 aa  67  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 628 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  24.85 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 368 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  24.46 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  22.26 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  29.68 
 
 		 1887 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  24.79 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  37.88 
 
 		 2170 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.19 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.75 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  23.71 
 
 		 394 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  21.47 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  43.56 
 
 		 1154 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  22.87 
 
 		 1041 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  24.3 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  21.78 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  22.46 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  41.28 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  22.58 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.31 
 
 		 703 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40 
 
 		 998 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  24.25 
 
 		 474 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  23.25 
 
 		 347 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  41.57 
 
 		 649 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  35.64 
 
 		 617 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.29 
 
 		 795 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  35.87 
 
 		 235 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  28.01 
 
 		 317 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  24.01 
 
 		 338 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  22.81 
 
 		 399 aa  53.9  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  45.35 
 
 		 1121 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  22.71 
 
 		 1059 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  22.71 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  22.57 
 
 		 486 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.65 
 
 		 880 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  25.17 
 
 		 690 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  24.46 
 
 		 376 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  24.73 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  45.35 
 
 		 973 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  24.53 
 
 		 370 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  35.64 
 
 		 1238 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  37.3 
 
 		 743 aa  51.2  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  38.24 
 
 		 900 aa  51.2  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  22.25 
 
 		 417 aa  51.2  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  23.71 
 
 		 370 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  23.81 
 
 		 407 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  22.09 
 
 		 392 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  30 
 
 		 1067 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.32 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  30.19 
 
 		 548 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.78 
 
 		 762 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.24 
 
 		 809 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.28 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  30.43 
 
 		 1089 aa  50.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  21.8 
 
 		 520 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>