48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2369 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 1014 aa  2066    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  36.28 
 
 		 457 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 606 aa  131  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  28.09 
 
 		 498 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  25.82 
 
 		 670 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  25.87 
 
 		 434 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  25.52 
 
 		 674 aa  99.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 639 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  23.56 
 
 		 975 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  37.68 
 
 		 1631 aa  89.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  34.34 
 
 		 4723 aa  88.6  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  31.6 
 
 		 1421 aa  88.6  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 760 aa  85.1  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  24.46 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  39.41 
 
 		 2193 aa  75.1  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  59.65 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  20.87 
 
 		 748 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  20.63 
 
 		 831 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  33.33 
 
 		 1202 aa  68.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  41.67 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  26.86 
 
 		 1323 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3391 aa  58.9  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.38 
 
 		 5899 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  23.46 
 
 		 574 aa  55.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2417  hypothetical protein  33.75 
 
 		 379 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2292  hypothetical protein  33.75 
 
 		 379 aa  55.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2253  hypothetical protein  43.14 
 
 		 383 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0525547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  32.5 
 
 		 480 aa  50.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  33.73 
 
 		 850 aa  49.7  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  44.26 
 
 		 567 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  23.21 
 
 		 1495 aa  48.5  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  37.29 
 
 		 542 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  25.68 
 
 		 487 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  34.12 
 
 		 275 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  52.08 
 
 		 778 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  27.89 
 
 		 934 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  34.12 
 
 		 275 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0001  hypothetical protein  32 
 
 		 292 aa  45.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2751  RatB  27.91 
 
 		 1861 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00947302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  42.62 
 
 		 308 aa  45.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.1 
 
 		 193 aa  44.3  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  27.97 
 
 		 657 aa  44.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>