86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1041 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  64.67 
 
 
806 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  58.34 
 
 
813 aa  825    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  62.19 
 
 
775 aa  915    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  100 
 
 
778 aa  1543    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  45.44 
 
 
887 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  39.5 
 
 
854 aa  364  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  40.29 
 
 
494 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  30.7 
 
 
897 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.71 
 
 
866 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  28.57 
 
 
948 aa  121  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  28.94 
 
 
814 aa  119  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
868 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  28.03 
 
 
876 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  45.36 
 
 
1010 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  39.8 
 
 
968 aa  81.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  41.49 
 
 
949 aa  75.5  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
976 aa  74.3  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.83 
 
 
944 aa  70.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  38.74 
 
 
561 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3709  peptidase S15  31.34 
 
 
519 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00862119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  24.77 
 
 
532 aa  62.4  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  36.52 
 
 
517 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  36.84 
 
 
542 aa  60.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.81 
 
 
572 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.73 
 
 
557 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
305 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  25.09 
 
 
567 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  25.09 
 
 
572 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  25.09 
 
 
572 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  36.11 
 
 
524 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1257  hypothetical protein  50 
 
 
297 aa  54.3  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 
286 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  26.95 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  22.78 
 
 
497 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  49.18 
 
 
1014 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  32.39 
 
 
218 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  34.16 
 
 
746 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.16 
 
 
3242 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  63.04 
 
 
692 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.84 
 
 
299 aa  52  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4994  hypothetical protein  32.16 
 
 
557 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.95 
 
 
2114 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.09 
 
 
2305 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  33.52 
 
 
3378 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  30.36 
 
 
3409 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  39.29 
 
 
497 aa  49.3  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  22.83 
 
 
562 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  61.36 
 
 
885 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  37.37 
 
 
488 aa  48.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
286 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  45.33 
 
 
848 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  36.92 
 
 
355 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  57.45 
 
 
355 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 
15245 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.8 
 
 
2310 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  36.92 
 
 
331 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  36 
 
 
228 aa  46.2  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  23.85 
 
 
292 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  30.7 
 
 
314 aa  45.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  36.47 
 
 
298 aa  45.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3329  hypothetical protein  29.63 
 
 
624 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  37.76 
 
 
979 aa  45.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  55.81 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  31.37 
 
 
302 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  46.55 
 
 
754 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  45.33 
 
 
623 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>