More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6528 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
868 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  46.37 
 
 
1010 aa  686    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  52.08 
 
 
814 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.22 
 
 
944 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  52.47 
 
 
876 aa  690    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  100 
 
 
897 aa  1774    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  46.33 
 
 
968 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
976 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  49.73 
 
 
948 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  50 
 
 
949 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  51.32 
 
 
866 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 
310 aa  210  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
311 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
302 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.18 
 
 
329 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  46 
 
 
318 aa  205  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.61 
 
 
300 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  50.45 
 
 
310 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  45.82 
 
 
326 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
301 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.58 
 
 
320 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  52.49 
 
 
322 aa  194  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
340 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  38.46 
 
 
303 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
331 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.16 
 
 
303 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  38.46 
 
 
331 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.46 
 
 
331 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  43.52 
 
 
302 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  37.76 
 
 
303 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  38.46 
 
 
303 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.76 
 
 
303 aa  191  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 
300 aa  190  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 
305 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  43.2 
 
 
323 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 
300 aa  190  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
346 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
351 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.89 
 
 
300 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 
307 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
305 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  31.81 
 
 
494 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.16 
 
 
341 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  38.98 
 
 
305 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  45.17 
 
 
326 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  41.46 
 
 
304 aa  188  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40 
 
 
305 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.67 
 
 
301 aa  189  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
305 aa  188  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  44.37 
 
 
342 aa  188  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
305 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.62 
 
 
304 aa  187  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
305 aa  187  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
305 aa  187  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 
300 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
305 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
305 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
306 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 
305 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
307 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.14 
 
 
304 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  43.65 
 
 
389 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
300 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  41.59 
 
 
299 aa  186  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 
300 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
305 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
300 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 
300 aa  184  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  40.98 
 
 
311 aa  184  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  43.01 
 
 
319 aa  184  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  33.67 
 
 
302 aa  184  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  38.03 
 
 
300 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 
318 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.15 
 
 
457 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 
309 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
309 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
309 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 
309 aa  180  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  40.97 
 
 
409 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
309 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.83 
 
 
247 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.58 
 
 
309 aa  179  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 
300 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  42.12 
 
 
322 aa  178  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
309 aa  178  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
309 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  46.22 
 
 
311 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
307 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  49.76 
 
 
347 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.03 
 
 
306 aa  177  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
300 aa  177  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
307 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.78 
 
 
319 aa  177  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  34.54 
 
 
316 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
330 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  35.64 
 
 
307 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
323 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.47 
 
 
324 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
307 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>