More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0778 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  51.73 
 
 		 876 aa  679    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.52 
 
 		 944 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 868 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  48.65 
 
 		 1010 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  50.28 
 
 		 866 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  52.8 
 
 		 968 aa  809    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  52.23 
 
 		 948 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  49.67 
 
 		 897 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  100 
 
 		 976 aa  1888    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  52.34 
 
 		 949 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 814 aa  621  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 302 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  45.8 
 
 		 304 aa  204  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.3 
 
 		 329 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 310 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.52 
 
 		 303 aa  195  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  42.02 
 
 		 310 aa  194  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 331 aa  194  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  38.52 
 
 		 331 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.52 
 
 		 303 aa  194  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.52 
 
 		 331 aa  193  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.66 
 
 		 320 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.13 
 
 		 301 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  38.52 
 
 		 303 aa  192  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 311 aa  191  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.09 
 
 		 457 aa  191  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  38.52 
 
 		 303 aa  191  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  38.52 
 
 		 303 aa  191  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.86 
 
 		 300 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 340 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.99 
 
 		 368 aa  189  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 351 aa  188  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  42.96 
 
 		 304 aa  188  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 		 300 aa  187  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.39 
 
 		 318 aa  187  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.56 
 
 		 326 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 300 aa  184  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 322 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.27 
 
 		 305 aa  184  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 306 aa  184  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  41.61 
 
 		 347 aa  184  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.05 
 
 		 324 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 346 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.07 
 
 		 300 aa  182  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 301 aa  181  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 		 300 aa  181  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  40.67 
 
 		 342 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.53 
 
 		 299 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.32 
 
 		 341 aa  179  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 309 aa  178  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  39.22 
 
 		 300 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 300 aa  177  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 300 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 300 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 300 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 		 300 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  43.15 
 
 		 322 aa  176  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 300 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 237 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  45.91 
 
 		 258 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 		 305 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  42.12 
 
 		 311 aa  174  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 305 aa  174  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 305 aa  174  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  39.19 
 
 		 355 aa  174  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 327 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  40.66 
 
 		 409 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 305 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  43.2 
 
 		 305 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 305 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  39.81 
 
 		 299 aa  172  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 305 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  43.5 
 
 		 238 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 305 aa  171  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 305 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 305 aa  171  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  40.85 
 
 		 254 aa  171  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.51 
 
 		 304 aa  171  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.48 
 
 		 319 aa  171  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  42.33 
 
 		 302 aa  171  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  47.55 
 
 		 311 aa  170  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 316 aa  170  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 300 aa  170  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 314 aa  169  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  38.31 
 
 		 302 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  49.51 
 
 		 302 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 305 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  40.14 
 
 		 305 aa  170  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.29 
 
 		 317 aa  168  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 323 aa  168  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  38.94 
 
 		 320 aa  168  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.09 
 
 		 247 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  41.64 
 
 		 326 aa  167  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  37.46 
 
 		 373 aa  167  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  32.56 
 
 		 319 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 319 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  40.56 
 
 		 314 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 313 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.45 
 
 		 318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 307 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>