More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 368 aa  737    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  74.36 
 
 		 457 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  57.91 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.03 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.9 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  54.03 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  66.67 
 
 		 238 aa  289  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  50.67 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  53.09 
 
 		 311 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  52.01 
 
 		 312 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  52.01 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  48.72 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.14 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  59.41 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  46.13 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 306 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  46.42 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  49.49 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  62.1 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  47.6 
 
 		 304 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  46.33 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.46 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  48.36 
 
 		 301 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.69 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 303 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  45.76 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  46 
 
 		 301 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.67 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.58 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.92 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  46.74 
 
 		 314 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  47.42 
 
 		 318 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  45.05 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  40.78 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  49.31 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  47.4 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.8 
 
 		 247 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  46.42 
 
 		 302 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  43.75 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  50.66 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 245 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 298 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 297 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  50.17 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.36 
 
 		 298 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  44.7 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.31 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  43.58 
 
 		 319 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  44.7 
 
 		 309 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.22 
 
 		 300 aa  239  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  45.93 
 
 		 306 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  50 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.1 
 
 		 308 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.27 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  41.31 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  45.89 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  42.28 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.44 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 327 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.05 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.97 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  45.21 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  44.86 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 234 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  41.94 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  43.73 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  43.64 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  41.16 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 242 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  43.22 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  53.96 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.42 
 
 		 244 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.7 
 
 		 237 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  57.28 
 
 		 237 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 337 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 310 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  46.39 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  44.26 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.6 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.76 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  38.59 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>