More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3386 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  67 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  66.78 
 
 		 320 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  63.84 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  62.66 
 
 		 309 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  61.51 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.6 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  60.8 
 
 		 335 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  60 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  58.25 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  58.94 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  58.17 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 319 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  58.63 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  60.93 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  56.08 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  57.57 
 
 		 316 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.6 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  55.91 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  58.17 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  56.68 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  55.59 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 312 aa  321  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  55.7 
 
 		 355 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  55.15 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  55.38 
 
 		 314 aa  318  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  53.99 
 
 		 368 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  54.72 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.97 
 
 		 317 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  54.64 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  54.64 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  54.64 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.78 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.15 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  53.29 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  52.63 
 
 		 301 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  52.4 
 
 		 327 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  52.48 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  52.46 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  53.8 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  53.8 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  53.49 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.48 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  51.32 
 
 		 306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  51.47 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.54 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  50.17 
 
 		 318 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  50.66 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.99 
 
 		 302 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 241 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  52.48 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.75 
 
 		 398 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  49.15 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  49.15 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 368 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.33 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.78 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.42 
 
 		 457 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  51.16 
 
 		 314 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  45.67 
 
 		 305 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.07 
 
 		 238 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  46.2 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.67 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 496 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 242 aa  215  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.81 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  43.14 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  51.89 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  46.67 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  47.37 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  43.71 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  43.77 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 237 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  53.96 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.95 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  40.37 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  49.31 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.71 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.62 
 
 		 264 aa  195  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.6 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  46.85 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>