More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0579 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  100 
 
 		 324 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  67.56 
 
 		 320 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.8 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  63.28 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  65.55 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  60.76 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  62.21 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.46 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  64.43 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  61.08 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  62.54 
 
 		 314 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  59.55 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  58.54 
 
 		 361 aa  361  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  60.92 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  58.47 
 
 		 314 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  60.46 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  60.2 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.69 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  59.55 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  59.93 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  60.94 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.2 
 
 		 314 aa  350  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  59.08 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  62.21 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  61.33 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  60.4 
 
 		 313 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  60.07 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  54.94 
 
 		 373 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  60.6 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.86 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  59.67 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  59.74 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  58.79 
 
 		 310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.71 
 
 		 302 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  55.81 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  54.85 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  54.97 
 
 		 301 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 305 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  54.9 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  57.57 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 303 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  53.51 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  52.96 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.49 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.19 
 
 		 305 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  53.18 
 
 		 308 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.33 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.17 
 
 		 252 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  51.71 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.67 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.09 
 
 		 398 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  47.63 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.61 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.77 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  43.75 
 
 		 457 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.65 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  45.39 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.67 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.33 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  55.77 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.44 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.11 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.78 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.55 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.3 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 242 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 496 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.74 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  44.48 
 
 		 317 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  45.64 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.56 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  45.85 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.83 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  48.94 
 
 		 258 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  45.18 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.9 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.53 
 
 		 264 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  40.67 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 254 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.03 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.07 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  37.13 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>