More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0397 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  95.65 
 
 
299 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  72.76 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  66.55 
 
 
309 aa  368  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  65.52 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  62.41 
 
 
298 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  62.84 
 
 
314 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  60.54 
 
 
300 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  59.59 
 
 
303 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  61.41 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
242 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.25 
 
 
350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  53.9 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  53.38 
 
 
314 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  52.04 
 
 
315 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.84 
 
 
318 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.67 
 
 
311 aa  259  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  61.86 
 
 
237 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  52.86 
 
 
318 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 
368 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.82 
 
 
457 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.85 
 
 
317 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  51.19 
 
 
301 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  49.66 
 
 
316 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49.01 
 
 
314 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
314 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  47.84 
 
 
320 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  49.5 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.8 
 
 
252 aa  245  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  50.66 
 
 
304 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  49.32 
 
 
355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
319 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
306 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.9 
 
 
324 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  44.17 
 
 
361 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
310 aa  241  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  47.95 
 
 
309 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  48.14 
 
 
319 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.63 
 
 
310 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  47.78 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  48.66 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  56.42 
 
 
313 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
398 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.69 
 
 
335 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  50 
 
 
318 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  48.81 
 
 
322 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.34 
 
 
330 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  48.33 
 
 
373 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.39 
 
 
348 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  47.44 
 
 
316 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
328 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.32 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  55.13 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  45.75 
 
 
368 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  46.51 
 
 
310 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  48.46 
 
 
303 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  58.17 
 
 
309 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
313 aa  228  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  45.05 
 
 
314 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.97 
 
 
298 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
303 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  45.85 
 
 
324 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.97 
 
 
305 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  47.08 
 
 
314 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  47.81 
 
 
313 aa  225  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  51 
 
 
304 aa  225  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  55.17 
 
 
244 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
312 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.97 
 
 
319 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  47.42 
 
 
300 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.03 
 
 
302 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.8 
 
 
302 aa  221  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  48.34 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  57.49 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  53.04 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
496 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  53.18 
 
 
302 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
305 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  45.93 
 
 
305 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.45 
 
 
238 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  45.39 
 
 
327 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  52.31 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  52.24 
 
 
258 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  41.5 
 
 
305 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
302 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
234 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.77 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.9 
 
 
264 aa  196  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  54.29 
 
 
310 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.56 
 
 
316 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  42.67 
 
 
307 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  49.1 
 
 
251 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  44.95 
 
 
254 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
230 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>