More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3742 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  64.38 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  63.19 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  63.28 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  61.46 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.68 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  60.39 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  60.78 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  60.78 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  60.78 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  60.59 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  57.7 
 
 		 322 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 301 aa  345  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.86 
 
 		 318 aa  344  8e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  56.54 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  60.58 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.21 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  56.86 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  54.55 
 
 		 335 aa  335  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  56.96 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  53.35 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  57.52 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  56.21 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  56.31 
 
 		 302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  54.02 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  54.66 
 
 		 313 aa  321  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  52.94 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  52.41 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.08 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.9 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  54.72 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.19 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  53.09 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  51.63 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  52.61 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.96 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  51.63 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  55.37 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  54.9 
 
 		 311 aa  298  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  51.46 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  55.23 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  49.03 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  51.15 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.5 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  50.97 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  51.63 
 
 		 457 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.01 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  48.52 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  50.33 
 
 		 316 aa  280  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  54.49 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  50.99 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 398 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 241 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  51.66 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.53 
 
 		 252 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.33 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 244 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.5 
 
 		 314 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  56.81 
 
 		 234 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.59 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.61 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  55.71 
 
 		 258 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 496 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  47.51 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.33 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.61 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  42.81 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  42.48 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  46.23 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  53.67 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.37 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  45.02 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  46.3 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.13 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.07 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  53.06 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>