More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6250 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  100 
 
 		 457 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  74.36 
 
 		 368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.36 
 
 		 324 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  54.33 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  54.05 
 
 		 311 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  48.45 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  63.3 
 
 		 238 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.83 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.48 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  47.44 
 
 		 368 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  53.26 
 
 		 302 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.48 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  47 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.63 
 
 		 317 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.39 
 
 		 310 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  49.17 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  45.83 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  43.79 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  47.95 
 
 		 322 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  50.34 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  59.55 
 
 		 245 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  46.56 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  45.86 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  47.84 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 303 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  45.42 
 
 		 315 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 328 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  45.33 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  46.96 
 
 		 316 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  43.23 
 
 		 309 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.63 
 
 		 318 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  60.93 
 
 		 258 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 314 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 316 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  45.61 
 
 		 314 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 314 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  42.53 
 
 		 314 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.29 
 
 		 247 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  45.52 
 
 		 298 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  45.95 
 
 		 304 aa  250  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 319 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  45.03 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 309 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  43.75 
 
 		 324 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  45.67 
 
 		 302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  45.03 
 
 		 301 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  45.7 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  50 
 
 		 307 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  45.21 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  44.33 
 
 		 309 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  42.61 
 
 		 320 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 		 327 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.58 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  47.77 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  45.42 
 
 		 313 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 330 aa  239  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 313 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  53.18 
 
 		 306 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.82 
 
 		 299 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.58 
 
 		 298 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 244 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  43.99 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.82 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  41.3 
 
 		 348 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 297 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.17 
 
 		 252 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  42.81 
 
 		 310 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 496 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 237 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  47.19 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  41.78 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 242 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 234 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  43.69 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  43.04 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 301 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  41.56 
 
 		 314 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  44.22 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 308 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  55.4 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  45.55 
 
 		 303 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 241 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 302 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.84 
 
 		 316 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 310 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.37 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 307 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 310 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>