More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 319 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  65.29 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  64.04 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.46 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  58.25 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  54.9 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  54.25 
 
 		 311 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.58 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  49.83 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  51.53 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  48.67 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  50.35 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49.15 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  48.81 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  48.81 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  49.32 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  48.81 
 
 		 373 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.23 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  52.26 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 346 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.37 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  46.44 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.09 
 
 		 238 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  47.8 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  48.96 
 
 		 355 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  47.26 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  59.81 
 
 		 245 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  49.48 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.26 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.86 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  50.34 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.26 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  48.63 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  48.63 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  48.63 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 298 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  46.33 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  60.37 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  49.13 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  44.18 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  46.18 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  48.97 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  44.83 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  47.95 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  42.99 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.64 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  46.6 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  46.58 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  43.28 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  42.21 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  42.81 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.06 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  47.84 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.87 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  47.02 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.82 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 297 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  47.12 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.45 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  42.47 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  44.44 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  43.3 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.58 
 
 		 252 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  43.15 
 
 		 310 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 241 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 234 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  48.51 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  55.81 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  42.03 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  53.7 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  53.27 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  46.08 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.97 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  47.14 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  55.4 
 
 		 237 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  48.16 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.19 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>