More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2470 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  100 
 
 
297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  72.76 
 
 
299 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  72.76 
 
 
299 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  67.46 
 
 
308 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  63.45 
 
 
309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  61.2 
 
 
300 aa  338  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  58.28 
 
 
303 aa  318  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  59.32 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  58.64 
 
 
298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.95 
 
 
350 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  68.04 
 
 
242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  57.89 
 
 
317 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  52.04 
 
 
308 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  50.17 
 
 
318 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  51.02 
 
 
315 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.66 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.52 
 
 
311 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  48.81 
 
 
319 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.34 
 
 
318 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  52.22 
 
 
314 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
330 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49.49 
 
 
314 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  61.43 
 
 
237 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.31 
 
 
368 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  51.02 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  48.12 
 
 
355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  51.01 
 
 
311 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
298 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.95 
 
 
317 aa  242  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  51.7 
 
 
304 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  50.84 
 
 
301 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  48.12 
 
 
457 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 
328 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.55 
 
 
324 aa  240  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
319 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.82 
 
 
310 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  47.78 
 
 
316 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
316 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  43.65 
 
 
361 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  50.67 
 
 
318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  48.82 
 
 
301 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  48.83 
 
 
302 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  47.8 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  45.97 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.66 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  46.76 
 
 
314 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.66 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.66 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.33 
 
 
252 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.08 
 
 
320 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  46.76 
 
 
335 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.49 
 
 
348 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
306 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  45.89 
 
 
309 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  45.55 
 
 
303 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  46.53 
 
 
368 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  45.97 
 
 
310 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  47.02 
 
 
314 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.61 
 
 
319 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  49.32 
 
 
303 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
312 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.74 
 
 
300 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  51.55 
 
 
304 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  57.42 
 
 
241 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  46.64 
 
 
373 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  46.92 
 
 
330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  45.3 
 
 
324 aa  221  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
305 aa  221  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.67 
 
 
302 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  51.63 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
496 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  54.87 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  45.02 
 
 
305 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
337 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.74 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  55.02 
 
 
309 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  53.1 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  46.13 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  47.71 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  50.6 
 
 
302 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  52.36 
 
 
258 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.89 
 
 
238 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  43.93 
 
 
327 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
302 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
234 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
330 aa  202  6e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  55.5 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.56 
 
 
247 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.04 
 
 
316 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
305 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.9 
 
 
264 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
311 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  42.09 
 
 
305 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  43.69 
 
 
326 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
318 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  43.38 
 
 
307 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>