More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3182 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  610  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  71.25 
 
 		 313 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  67.43 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  66.22 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  62.09 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  63.33 
 
 		 315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  59.53 
 
 		 335 aa  358  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  63.21 
 
 		 314 aa  355  7.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.65 
 
 		 318 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  59.2 
 
 		 314 aa  348  5e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  62.21 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.53 
 
 		 317 aa  343  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.2 
 
 		 319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  58.47 
 
 		 316 aa  342  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 313 aa  341  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  62.46 
 
 		 318 aa  341  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  58.55 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  57.86 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  53.15 
 
 		 361 aa  335  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  55.91 
 
 		 313 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  59.2 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  57.19 
 
 		 373 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  56.77 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  56.48 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  56.23 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  57.56 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  56.33 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  56.25 
 
 		 304 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  56 
 
 		 301 aa  312  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 328 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.49 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  55.7 
 
 		 301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  53.72 
 
 		 327 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  53.04 
 
 		 314 aa  298  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  52.82 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  53.95 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.8 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  53.51 
 
 		 308 aa  292  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  51.16 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  50.84 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  52.81 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  54 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.81 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.99 
 
 		 252 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  49.52 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  48.82 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  61.64 
 
 		 241 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.11 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  48 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  47.44 
 
 		 314 aa  244  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  46.39 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  46.23 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  48.14 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.37 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  42.81 
 
 		 457 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.86 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  56.04 
 
 		 234 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.15 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  53.49 
 
 		 496 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.39 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  43.54 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  47.19 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.49 
 
 		 238 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  46.51 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 242 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  41.22 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  42.66 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.48 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  40.54 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 237 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  41.69 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  43.29 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  41.45 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  52.94 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.93 
 
 		 247 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0751  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4316  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.4 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  37 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.33 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  49.35 
 
 		 232 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>