More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1681 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  79.53 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.17 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  51.51 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  50 
 
 		 373 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  50.17 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  49.01 
 
 		 368 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  48.49 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  51.51 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  49.83 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  49.5 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  49.83 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  51.9 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  51.01 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  51.01 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  51.01 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  48.49 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  49.17 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 314 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  44.95 
 
 		 361 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  47.67 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  46.67 
 
 		 315 aa  255  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  47.97 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  49.83 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  49.16 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  50.17 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  46.15 
 
 		 314 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  48.5 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.32 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  48.15 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  47.46 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  47.33 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  49.17 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.83 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 346 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  45.52 
 
 		 457 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  47.64 
 
 		 330 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  50 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  47.14 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 241 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.3 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.9 
 
 		 368 aa  245  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.92 
 
 		 319 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  45.3 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.46 
 
 		 302 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  49.5 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48.45 
 
 		 314 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 398 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  48.48 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  46.92 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.5 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  46.55 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 242 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  46.18 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.42 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  42.62 
 
 		 305 aa  226  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  48.45 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  54.33 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.4 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  43.99 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  52.78 
 
 		 234 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.29 
 
 		 350 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.63 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  40.39 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.03 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 244 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.97 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  53.74 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  43.4 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  55.07 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  53.03 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.37 
 
 		 264 aa  205  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  36.88 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  41.36 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  52.31 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 496 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.86 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>