More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1804 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.29 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  55.93 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  54.43 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  50.83 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.01 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.18 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  50.99 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  50.99 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  49.33 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  49.49 
 
 		 308 aa  255  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  46.76 
 
 		 373 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  46.42 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  47.12 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  60 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  46.92 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.93 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 346 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 319 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  46.62 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  46.39 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  47.08 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  46.42 
 
 		 368 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.27 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  44.52 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  47.08 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  43.79 
 
 		 361 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  46.84 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  45.54 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  45.54 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  45.54 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  46.62 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  44.04 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  48.31 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  44.59 
 
 		 318 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  44.67 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  44.67 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  45.67 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  45.02 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  57.35 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  56.28 
 
 		 258 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  44.3 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  45.82 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.98 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 298 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  43.73 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  42.32 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  41.75 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  44.04 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  44.93 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.12 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  39.59 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  45.12 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  41.89 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  42.09 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  52.15 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.43 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.12 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 241 aa  212  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  40.54 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  42 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  44.78 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 398 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  38.18 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  42.23 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  41.47 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  40.4 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 242 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 244 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  54.85 
 
 		 237 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  46.86 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  41.95 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  41.5 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  41.83 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 496 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  39.5 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  40.95 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  43 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>