More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3888 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  454  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  61.57 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  59.53 
 
 		 314 aa  252  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  59.74 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  55.22 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  57.94 
 
 		 311 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  56.28 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.54 
 
 		 324 aa  241  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.52 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  56.28 
 
 		 298 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 		 368 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  56.54 
 
 		 311 aa  235  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  53.67 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  55.4 
 
 		 457 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  53.42 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  54.05 
 
 		 300 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  54.05 
 
 		 300 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  54.05 
 
 		 300 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  52.29 
 
 		 322 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  57.41 
 
 		 309 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.09 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  55.07 
 
 		 298 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  54.93 
 
 		 316 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 330 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  51.38 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.93 
 
 		 308 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  54.93 
 
 		 318 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  54.35 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.38 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  50 
 
 		 315 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  55.4 
 
 		 302 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 303 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.4 
 
 		 319 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.21 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  49.54 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  53.27 
 
 		 302 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.53 
 
 		 350 aa  217  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.5 
 
 		 304 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  53.04 
 
 		 299 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.4 
 
 		 318 aa  215  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  54.85 
 
 		 305 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  51.87 
 
 		 398 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  54.46 
 
 		 328 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  50.94 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  48.65 
 
 		 368 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  50 
 
 		 373 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  50 
 
 		 361 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  53.04 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  51.4 
 
 		 301 aa  211  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  53.05 
 
 		 303 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  52.97 
 
 		 314 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  49.54 
 
 		 335 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.3 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.15 
 
 		 310 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  49.53 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  49.35 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  53.52 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 314 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  49.77 
 
 		 306 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.07 
 
 		 306 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  50 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  56.41 
 
 		 317 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  46.05 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  46.33 
 
 		 320 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  47.2 
 
 		 319 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  49.77 
 
 		 305 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  54.84 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.3 
 
 		 348 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  51.4 
 
 		 318 aa  198  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  47.84 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 496 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  46.85 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  50.48 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  48.17 
 
 		 309 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  44.5 
 
 		 313 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  47.8 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  53.07 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.66 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  46.26 
 
 		 324 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  46.05 
 
 		 310 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  51.87 
 
 		 310 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.75 
 
 		 254 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>