More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5617 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 328 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  70.81 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  67.44 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.44 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  62.88 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  61.39 
 
 		 315 aa  358  9e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  62.21 
 
 		 306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.54 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  60.27 
 
 		 355 aa  351  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  63.88 
 
 		 319 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  63 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  66.78 
 
 		 304 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  59.67 
 
 		 316 aa  345  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.91 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  59.53 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  56.88 
 
 		 361 aa  335  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  59.73 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  60.27 
 
 		 313 aa  332  6e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  62.38 
 
 		 305 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  59.6 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  58.47 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  58.36 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  57.14 
 
 		 322 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  57.86 
 
 		 368 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  56.6 
 
 		 373 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  58.53 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  55.77 
 
 		 319 aa  325  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  60.2 
 
 		 300 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  60.2 
 
 		 300 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  60.2 
 
 		 300 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.27 
 
 		 312 aa  325  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  60.74 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  58.77 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  55.17 
 
 		 318 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  55.59 
 
 		 313 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  59.14 
 
 		 302 aa  321  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.53 
 
 		 314 aa  321  9.000000000000001e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  60.46 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  58.86 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  60 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  53.5 
 
 		 314 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  59.21 
 
 		 305 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 310 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  58.28 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  58.47 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  59.14 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  57.38 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  54.95 
 
 		 330 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  56.11 
 
 		 306 aa  305  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  56.25 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  53.82 
 
 		 313 aa  298  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  52.56 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  52.6 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.57 
 
 		 252 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  66.05 
 
 		 241 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.19 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  49.32 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.49 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  50 
 
 		 300 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.81 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  46.58 
 
 		 457 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.25 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  47.12 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  62.02 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  57.01 
 
 		 234 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  47.71 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  47.08 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  56.28 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.9 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.05 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  43.92 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.6 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  48.29 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.99 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  44.52 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 245 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 496 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  45.36 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  44.27 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  46.78 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  52.09 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.92 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.38 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  54.46 
 
 		 237 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  43.67 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>