More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0100 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 330 aa  682    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  49.22 
 
 		 314 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.49 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  48.31 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  50.81 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  47.65 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  46.71 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  46.88 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  47.45 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  46.5 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  45.93 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  45.66 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.57 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  45.98 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  45.28 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  46.28 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  44.3 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  47.4 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  44.3 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  48.38 
 
 		 304 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  44.83 
 
 		 309 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  42.94 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  44.63 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  45.28 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  44.63 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.26 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  45.18 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  45.18 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  45.18 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  43.69 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.88 
 
 		 317 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 241 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 303 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  43.27 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  42.02 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  40.56 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  41.8 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  43.14 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.21 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  43.85 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  44.85 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  42 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  42.38 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  43 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  42.07 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  41.83 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  39.94 
 
 		 457 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  41.35 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  40.58 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.2 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 234 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  43 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.76 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 242 aa  225  8e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 244 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  38.36 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  42.11 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 298 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.57 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  39.35 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  38.36 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  37.86 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  38.76 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  44.95 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  45.11 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  38.39 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 237 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  47.21 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  48.8 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.19 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.66 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 247 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.04 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  36.04 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  36.04 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.22 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.22 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.71 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  45.66 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>