More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4497 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  72.54 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  66.45 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  69.21 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  57.97 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  63.51 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  57.33 
 
 		 303 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  62.84 
 
 		 299 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  71.82 
 
 		 242 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.67 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  56.31 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  61.82 
 
 		 237 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  56.19 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  52.9 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.17 
 
 		 324 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.81 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  51.36 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  53.54 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  54.58 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  52.2 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  49.15 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  51.35 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  49.66 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  47.44 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  48.81 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  49.15 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  49.49 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  49.15 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  48.82 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  51.16 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  58.56 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  59.53 
 
 		 237 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.56 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  48 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  50.85 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  52.46 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.59 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  46.64 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  46.28 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.89 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.82 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  46.44 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  47.83 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  47.8 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  44.3 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  46.62 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  47.54 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  50 
 
 		 309 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  49.32 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  49.32 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  49.32 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  46.78 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  48.49 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.58 
 
 		 238 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  44.95 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  54.95 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  43.69 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  49 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  42.65 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  48.14 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  50.42 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  48.49 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  49.33 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.39 
 
 		 247 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 245 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  45.64 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  46.6 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  47.3 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.78 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  51.8 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  44.48 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  43.73 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  44.37 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  48.17 
 
 		 254 aa  199  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 496 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2958  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  53.6 
 
 		 232 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>