More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1113 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  89.33 
 
 		 300 aa  547  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  67.24 
 
 		 300 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 301 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  53.04 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  47.47 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  48.82 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  47.81 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  42.62 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  46.93 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  54.46 
 
 		 347 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  45.36 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.33 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  45.67 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  40.13 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  45.36 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.59 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  36.7 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  42.62 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  39.46 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  38.21 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  54.71 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.53 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  41.08 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  40 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5295  ABC transporter related  43.53 
 
 		 406 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.569145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  52.38 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 351 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  42.57 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  41.18 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 309 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  43.1 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.88 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.95 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  39.6 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  42.47 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  52.51 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.88 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.18 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  43.77 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  44.59 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  41.36 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0249  ABC transporter related  42.72 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  44.01 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.96 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  38.67 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  44.86 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  44.48 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  44.86 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  44.86 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  44.11 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  42.71 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  43 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  40.74 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  34.32 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  40.53 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  38.24 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.04 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.33 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>