More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1150 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  93.14 
 
 
306 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  92.81 
 
 
306 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  49.34 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  46.15 
 
 
312 aa  272  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  41.23 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  39.09 
 
 
318 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 
328 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 
328 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.24 
 
 
301 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 
329 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.81 
 
 
282 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  44.66 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  42.31 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  42.31 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  37.38 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.16 
 
 
300 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
356 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  37.7 
 
 
311 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
309 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  44.66 
 
 
314 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.98 
 
 
326 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.25 
 
 
318 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.67 
 
 
304 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  36.19 
 
 
312 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  43.56 
 
 
328 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 
339 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 
266 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  36.6 
 
 
307 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.38 
 
 
308 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.11 
 
 
327 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  43.41 
 
 
340 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  43.28 
 
 
306 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.84 
 
 
324 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
280 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  39.11 
 
 
906 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.11 
 
 
906 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  34.06 
 
 
325 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 
312 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
251 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.97 
 
 
330 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 
325 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
280 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  38.93 
 
 
906 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  38.41 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  42.25 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.65 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  37.01 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  40.08 
 
 
906 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
307 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.45 
 
 
318 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.13 
 
 
328 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
301 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  33.98 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  42.4 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
350 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
305 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 
324 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.32 
 
 
312 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
302 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.63 
 
 
319 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 
255 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
255 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
309 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  40.45 
 
 
322 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
309 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
309 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 
322 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.35 
 
 
330 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
302 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  35.92 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
312 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  42.25 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  35.24 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.03 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.87 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  35.67 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  34.95 
 
 
316 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
312 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  42.67 
 
 
318 aa  179  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
312 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  41.04 
 
 
325 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 
281 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  41.15 
 
 
330 aa  178  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  37.74 
 
 
288 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>