More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2586 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  72.82 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  67.37 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  61.46 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  53.55 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  55.92 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  52.65 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  48.92 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  44.98 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  51.1 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  50 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  42.28 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  43.81 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.77 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  42.6 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  37.91 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  37.01 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  43.13 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  39.86 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  37.25 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.82 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  40.83 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  45.02 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  44.55 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  44.5 
 
 		 326 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.46 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.46 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  39.46 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  42.06 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  41.47 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  45.81 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  43.4 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  44.44 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  37.59 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.98 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  43.75 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  41.26 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  35.2 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  42.74 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.63 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  43.26 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  42.6 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.73 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.07 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  42.13 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.46 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  36.4 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 332 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.91 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  37.14 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.13 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  40.08 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  44.73 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  36.32 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  44.34 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>