More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1236 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  617  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  86.77 
 
 
310 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  55.7 
 
 
302 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  53.97 
 
 
331 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
305 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  45.21 
 
 
300 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  46.67 
 
 
305 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  41.88 
 
 
315 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  44.12 
 
 
303 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
332 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  45.07 
 
 
342 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  38.76 
 
 
287 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  41.04 
 
 
326 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
367 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  38.44 
 
 
288 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  40.26 
 
 
327 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.39 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  39.62 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 
296 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 
318 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
309 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  46.72 
 
 
318 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 
318 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
310 aa  192  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.83 
 
 
356 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  38.89 
 
 
339 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  43.72 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.91 
 
 
316 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  44.21 
 
 
247 aa  188  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  41.45 
 
 
292 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.13 
 
 
300 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  39.17 
 
 
330 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  49.06 
 
 
316 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.95 
 
 
304 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  44.5 
 
 
325 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  46.43 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
303 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  36.77 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.26 
 
 
316 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.89 
 
 
328 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  37.94 
 
 
326 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  38.69 
 
 
308 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  44.34 
 
 
313 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
309 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 
309 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
327 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
309 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
309 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  46.67 
 
 
326 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.07 
 
 
321 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.98 
 
 
337 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
301 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.01 
 
 
311 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  41.9 
 
 
303 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  43.4 
 
 
313 aa  175  8e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.03 
 
 
325 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  47.39 
 
 
242 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.2 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  43.69 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  31.61 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  44.6 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  36.66 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.69 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  45.54 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  46.89 
 
 
250 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  38.61 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
327 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
309 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.33 
 
 
298 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
309 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  40.89 
 
 
309 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  39.53 
 
 
257 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  46.98 
 
 
389 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.89 
 
 
303 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  34.5 
 
 
320 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.73 
 
 
315 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  36.83 
 
 
308 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
316 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.23 
 
 
325 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  40.83 
 
 
236 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
309 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.5 
 
 
310 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.63 
 
 
318 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 
307 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
369 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  34.21 
 
 
307 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.01 
 
 
304 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  38.67 
 
 
309 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.13 
 
 
297 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
411 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
297 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.15 
 
 
300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>