More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
307 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  92.18 
 
 
307 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  75.16 
 
 
307 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  74.92 
 
 
306 aa  457  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
308 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  62.01 
 
 
308 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  55.3 
 
 
306 aa  341  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  54.61 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  55.91 
 
 
323 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  56.76 
 
 
240 aa  264  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.71 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
369 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.49 
 
 
331 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  44.66 
 
 
311 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  39.67 
 
 
308 aa  239  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.13 
 
 
319 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  41.51 
 
 
320 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  41.51 
 
 
320 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.4 
 
 
360 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
315 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  39.2 
 
 
305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  50.46 
 
 
236 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.27 
 
 
328 aa  229  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  38.31 
 
 
310 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
311 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 
316 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.94 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  48.4 
 
 
315 aa  225  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  40.52 
 
 
329 aa  225  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  46.96 
 
 
235 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  46.61 
 
 
317 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
261 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.77 
 
 
344 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.87 
 
 
299 aa  221  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.36 
 
 
305 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.38 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  42.35 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  53.64 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.21 
 
 
301 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  40.93 
 
 
317 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.1 
 
 
298 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.16 
 
 
331 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
309 aa  204  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  34.85 
 
 
314 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  36.39 
 
 
309 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  47.34 
 
 
247 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  45.62 
 
 
341 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  34.65 
 
 
309 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.44 
 
 
308 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.21 
 
 
309 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.65 
 
 
305 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
308 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.54 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
301 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.17 
 
 
327 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.89 
 
 
325 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  31.07 
 
 
310 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.95 
 
 
328 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.09 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  32.4 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.18 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.33 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  40.54 
 
 
585 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33 
 
 
327 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.43 
 
 
312 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
311 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.79 
 
 
333 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 
308 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  32.05 
 
 
320 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.83 
 
 
1171 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
321 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.5 
 
 
328 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.24 
 
 
305 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  38.85 
 
 
318 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
328 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
261 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.51 
 
 
310 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  37.3 
 
 
300 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
312 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.25 
 
 
324 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 
334 aa  169  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  35.41 
 
 
314 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  39.64 
 
 
581 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 
325 aa  168  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.12 
 
 
583 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 
300 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.77 
 
 
316 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
312 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 
321 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.94 
 
 
580 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>