More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2114 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
261 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
261 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
315 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.84 
 
 
236 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.33 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  39.53 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.13 
 
 
344 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.25 
 
 
305 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40.47 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
369 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
308 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.66 
 
 
319 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.28 
 
 
325 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
314 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.5 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.9 
 
 
320 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.9 
 
 
320 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
317 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.13 
 
 
360 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
307 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.14 
 
 
240 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.6 
 
 
331 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.05 
 
 
308 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
336 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.74 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.57 
 
 
303 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  37.39 
 
 
311 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  32.6 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  35.93 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.82 
 
 
299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  35.78 
 
 
323 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.29 
 
 
328 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.78 
 
 
305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  40.27 
 
 
317 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.56 
 
 
307 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
312 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 
311 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  35.53 
 
 
306 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.69 
 
 
298 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  34.38 
 
 
310 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.43 
 
 
301 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  33.33 
 
 
341 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  35.21 
 
 
325 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  30.25 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
309 aa  152  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  31.96 
 
 
309 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.16 
 
 
308 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.22 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  33.63 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
308 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  33.49 
 
 
289 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  34.87 
 
 
314 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  32.1 
 
 
247 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  30.74 
 
 
308 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  29.41 
 
 
331 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.5 
 
 
305 aa  141  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  29.26 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.01 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  32.56 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  33.19 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  35.45 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  30.53 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.73 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  31.51 
 
 
252 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  29.13 
 
 
274 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  31.28 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
294 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
294 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.48 
 
 
295 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 
323 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
303 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.65 
 
 
334 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
294 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
303 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  30 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  30.77 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  31.84 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.51 
 
 
303 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 
294 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  31.8 
 
 
312 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  32.2 
 
 
335 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  36.12 
 
 
304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.8 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  30.4 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  32.16 
 
 
244 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  28.76 
 
 
338 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  28.89 
 
 
328 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.04 
 
 
323 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.87 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.11 
 
 
294 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 
294 aa  131  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  31.72 
 
 
244 aa  131  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>