More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6081 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  100 
 
 
317 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  43.85 
 
 
316 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.18 
 
 
325 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.25 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 
317 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  39.87 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  40.75 
 
 
317 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
336 aa  231  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.61 
 
 
308 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.32 
 
 
320 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.32 
 
 
320 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.14 
 
 
331 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.23 
 
 
360 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
315 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.17 
 
 
344 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.42 
 
 
328 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.46 
 
 
303 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.78 
 
 
305 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  39.37 
 
 
311 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  47.71 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.54 
 
 
310 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  39.87 
 
 
329 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.48 
 
 
305 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
314 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  42.31 
 
 
331 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.63 
 
 
322 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.71 
 
 
301 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.62 
 
 
310 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.11 
 
 
299 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  38.34 
 
 
339 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.95 
 
 
298 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
311 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  38.66 
 
 
341 aa  199  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  37.06 
 
 
306 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
309 aa  194  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  193  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  41.59 
 
 
306 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  36.08 
 
 
317 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.51 
 
 
308 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.74 
 
 
307 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  34.42 
 
 
309 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  41.55 
 
 
240 aa  185  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.94 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  44.6 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
308 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
307 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  44.04 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.14 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  39.06 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 
307 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.87 
 
 
321 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
302 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  39.73 
 
 
235 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
261 aa  175  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
318 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  36.54 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.51 
 
 
293 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
261 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.91 
 
 
316 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.05 
 
 
309 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40 
 
 
301 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  36.51 
 
 
331 aa  168  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
305 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.57 
 
 
328 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 
244 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.18 
 
 
245 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  39.91 
 
 
247 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.8 
 
 
316 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
305 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
360 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
305 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  31.41 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.46 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.21 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.18 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.86 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  37.73 
 
 
244 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.01 
 
 
244 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.01 
 
 
244 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  38.01 
 
 
244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.54 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  37.56 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  37.56 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
308 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  36.24 
 
 
244 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  40.48 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  38.64 
 
 
244 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 
309 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.1 
 
 
244 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  35.91 
 
 
310 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  31.83 
 
 
291 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.67 
 
 
328 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>