More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3013 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  100 
 
 		 360 aa  735    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  43.81 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  43.61 
 
 		 328 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  43.04 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  42.36 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  40.78 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  41.78 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  43.05 
 
 		 316 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  38.31 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.49 
 
 		 306 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  38.8 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.13 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  45.45 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  36.07 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.62 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  35.18 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.37 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.53 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.67 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  34.2 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  41.2 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  32.03 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  31.7 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.27 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.4 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.66 
 
 		 299 aa  173  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.98 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  39.44 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.72 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  36.47 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33.55 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.19 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  39.51 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  31.19 
 
 		 326 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  34.81 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.03 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  31.11 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.03 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.16 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  40.28 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  39.91 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  39.23 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.39 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.3 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  35.46 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.19 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.09 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  31.09 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.72 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.81 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.02 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.81 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  38.81 
 
 		 313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  32.39 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.68 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  32.39 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  32.95 
 
 		 308 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  32.29 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  34.5 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.93 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  38.16 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.05 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  36.75 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.32 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>