More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2142 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  53.25 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  50 
 
 
317 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
308 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
322 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
317 aa  242  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  43.65 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.58 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  40.78 
 
 
298 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.04 
 
 
301 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  47.43 
 
 
325 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  43.41 
 
 
329 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
315 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  41.8 
 
 
305 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 
307 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 
316 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  43.37 
 
 
360 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
314 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  43.37 
 
 
344 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  40.71 
 
 
303 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.58 
 
 
240 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  38.54 
 
 
315 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
369 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.5 
 
 
308 aa  223  4e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  49.32 
 
 
236 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  40.84 
 
 
310 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  41.07 
 
 
331 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.59 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.46 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  42.48 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.56 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
308 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  39.74 
 
 
306 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  39.3 
 
 
331 aa  215  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  41.03 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  41.03 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  41.03 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  38.98 
 
 
308 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.97 
 
 
323 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 
312 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  42.25 
 
 
310 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  39.42 
 
 
311 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  39.3 
 
 
316 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
317 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  37.9 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  46.43 
 
 
247 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  46.79 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  45.87 
 
 
341 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
261 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  39.4 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.67 
 
 
309 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  32.48 
 
 
309 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.44 
 
 
308 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
305 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  45.66 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  44.75 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
318 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.66 
 
 
310 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  43.38 
 
 
337 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  43.03 
 
 
245 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
309 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  38.11 
 
 
326 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.98 
 
 
301 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.39 
 
 
309 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
329 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.01 
 
 
310 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  37.32 
 
 
296 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  35.58 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.94 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.59 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 
309 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 
309 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
321 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 
309 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  41.18 
 
 
293 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
303 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  41.18 
 
 
288 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 
301 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
301 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
309 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.91 
 
 
295 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
309 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
309 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  30.87 
 
 
308 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
311 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.27 
 
 
327 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  37.84 
 
 
298 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
314 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
328 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  33.44 
 
 
319 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
302 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 
307 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.48 
 
 
306 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  34.29 
 
 
312 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>