More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3248 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  59.4 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  60.18 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  61.19 
 
 		 303 aa  281  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  56.82 
 
 		 305 aa  271  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  57.14 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  56.82 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.5 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  53.15 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  241  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 308 aa  241  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  51.82 
 
 		 307 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 312 aa  234  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  55.66 
 
 		 325 aa  234  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  48.91 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  50.44 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 315 aa  228  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  50.23 
 
 		 344 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 307 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  50 
 
 		 360 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  51.43 
 
 		 320 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  51.43 
 
 		 320 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  52.13 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  46.29 
 
 		 323 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  51.9 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  50.95 
 
 		 331 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 314 aa  218  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  49.76 
 
 		 319 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  47.26 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  52.11 
 
 		 315 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  45.78 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  48.36 
 
 		 310 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  47 
 
 		 329 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  45.91 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  44.1 
 
 		 308 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  48.57 
 
 		 328 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  45.02 
 
 		 341 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  43.67 
 
 		 308 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 		 311 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  44.29 
 
 		 339 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  44.98 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.2 
 
 		 313 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  40.77 
 
 		 313 aa  192  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 309 aa  188  5e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  42.51 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  41.44 
 
 		 331 aa  187  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  40.27 
 
 		 314 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  41.96 
 
 		 317 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.36 
 
 		 332 aa  184  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.66 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  42.59 
 
 		 315 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  38.36 
 
 		 309 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.45 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  42.29 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 327 aa  174  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.57 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 356 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  41.85 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.21 
 
 		 304 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  41.33 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.17 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 316 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.18 
 
 		 308 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.5 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.85 
 
 		 305 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  39.48 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.64 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.75 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.36 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  38.57 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  42.27 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 344 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  39.55 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 241 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  41.07 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.08 
 
 		 510 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 341 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  37.61 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  37.12 
 
 		 308 aa  168  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  39.83 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  34.96 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 287 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>