More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  81.97 
 
 
307 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  77.2 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.92 
 
 
307 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  61.36 
 
 
308 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  61.18 
 
 
308 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  57.62 
 
 
306 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  59.68 
 
 
323 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  49.51 
 
 
308 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  56.44 
 
 
240 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  40.2 
 
 
308 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  43.99 
 
 
331 aa  248  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.57 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  46.3 
 
 
319 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.53 
 
 
328 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.78 
 
 
329 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.77 
 
 
360 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.51 
 
 
325 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  41.64 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  48.91 
 
 
235 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  40.44 
 
 
320 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  40.44 
 
 
320 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  46.4 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  47.04 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 
316 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42.77 
 
 
311 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  43.75 
 
 
339 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.51 
 
 
316 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.38 
 
 
344 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  38.83 
 
 
310 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  40.33 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  42.81 
 
 
310 aa  222  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 
314 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  39.07 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 
317 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  54.09 
 
 
245 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 
311 aa  218  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.54 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
322 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.55 
 
 
298 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  41.09 
 
 
317 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.44 
 
 
301 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.89 
 
 
341 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.1 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
317 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  38.16 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
309 aa  194  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  48.36 
 
 
247 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  35.53 
 
 
314 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  38.31 
 
 
325 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 
327 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  37.54 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  43.69 
 
 
582 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 
308 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.22 
 
 
308 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  42.53 
 
 
576 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  41.59 
 
 
578 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.84 
 
 
316 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  42.47 
 
 
590 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.42 
 
 
309 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.9 
 
 
312 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.33 
 
 
590 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
309 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
253 aa  175  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.9 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  40.56 
 
 
580 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.18 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  34.42 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  33.44 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.47 
 
 
594 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  40 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
585 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.89 
 
 
585 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  31.94 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  40.64 
 
 
575 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  37.84 
 
 
580 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
356 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
580 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.29 
 
 
576 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  40.99 
 
 
581 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  37.67 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  43.52 
 
 
578 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  38.12 
 
 
580 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  32.89 
 
 
309 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>