More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2842 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  100 
 
 
317 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  49.68 
 
 
339 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
311 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
308 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
322 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
369 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  41.43 
 
 
306 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 
316 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
315 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  39.1 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.86 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
314 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.54 
 
 
307 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  41.09 
 
 
306 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 
307 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 
312 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
307 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.21 
 
 
325 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.59 
 
 
344 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
308 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  43.56 
 
 
236 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
336 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.79 
 
 
301 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.1 
 
 
305 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  37.46 
 
 
311 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  38.54 
 
 
323 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.66 
 
 
303 aa  202  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  39.15 
 
 
308 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  45.62 
 
 
298 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.43 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.95 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  41.33 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.95 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.53 
 
 
310 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.31 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.97 
 
 
319 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.2 
 
 
331 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.74 
 
 
328 aa  192  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  38.28 
 
 
310 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.67 
 
 
299 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
261 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.74 
 
 
320 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.74 
 
 
320 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
317 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  34.81 
 
 
360 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  41.96 
 
 
235 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  37.55 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  32.69 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.82 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.66 
 
 
325 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  35.52 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  38.07 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.08 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  41.98 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.06 
 
 
291 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  41.9 
 
 
293 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.46 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
312 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
312 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
312 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
307 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.77 
 
 
312 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.36 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
305 aa  162  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  31.35 
 
 
309 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2114  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
261 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
312 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  37.05 
 
 
303 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
308 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  35.41 
 
 
326 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  30.77 
 
 
337 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  37.44 
 
 
295 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.21 
 
 
578 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  38.18 
 
 
300 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  37.36 
 
 
286 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  30.5 
 
 
319 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  30.87 
 
 
318 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  32.2 
 
 
309 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  32.79 
 
 
317 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
288 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  30.06 
 
 
316 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  40.59 
 
 
247 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  29.65 
 
 
319 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.01 
 
 
299 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
244 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  36.94 
 
 
295 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.19 
 
 
575 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  31.17 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  39.35 
 
 
594 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
305 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.38 
 
 
328 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.14 
 
 
297 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  31.6 
 
 
310 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>