More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2070 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  100 
 
 
316 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
308 aa  279  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  42.17 
 
 
303 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.22 
 
 
325 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  41.77 
 
 
298 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  42.22 
 
 
369 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.89 
 
 
305 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  41.27 
 
 
305 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  52.05 
 
 
236 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  41.64 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.14 
 
 
299 aa  238  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.49 
 
 
310 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
314 aa  238  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.37 
 
 
315 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  41.72 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.95 
 
 
316 aa  235  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.73 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  39.81 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  46.86 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.66 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.03 
 
 
329 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40.06 
 
 
307 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
336 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  40.71 
 
 
306 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.26 
 
 
328 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  49.77 
 
 
235 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  41.67 
 
 
311 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 
311 aa  229  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
322 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 
307 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  36.1 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.26 
 
 
331 aa  225  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.58 
 
 
320 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.58 
 
 
320 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
312 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  39.68 
 
 
317 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  39.02 
 
 
319 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.58 
 
 
301 aa  220  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 
317 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.9 
 
 
317 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
309 aa  217  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.26 
 
 
308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
308 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  37.46 
 
 
341 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  42.52 
 
 
331 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.24 
 
 
310 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  46.57 
 
 
247 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.62 
 
 
325 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.02 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.75 
 
 
308 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
321 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  36.79 
 
 
316 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  41.9 
 
 
314 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  40.19 
 
 
319 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.36 
 
 
309 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
308 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.55 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  41.59 
 
 
306 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.82 
 
 
312 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.78 
 
 
316 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
309 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
251 aa  178  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
341 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.1 
 
 
316 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40 
 
 
309 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  34.71 
 
 
309 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.84 
 
 
243 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40 
 
 
337 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
316 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  33.65 
 
 
318 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  32.91 
 
 
306 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  41.38 
 
 
245 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42.2 
 
 
332 aa  175  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  44.13 
 
 
317 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.97 
 
 
246 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.59 
 
 
315 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.02 
 
 
243 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.83 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.64 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  43.6 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  41.86 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  37.96 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.25 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  37.99 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  34.63 
 
 
316 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
327 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  40.89 
 
 
304 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40.25 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  41.4 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.67 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>