More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2419 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  100 
 
 
328 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  88.11 
 
 
328 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  58.54 
 
 
319 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  64.94 
 
 
316 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  54.6 
 
 
321 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 
308 aa  334  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  48.47 
 
 
316 aa  297  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
308 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  43.52 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  44.13 
 
 
306 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  45.31 
 
 
317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  45.31 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  44.27 
 
 
313 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
360 aa  252  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  44.69 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  38.27 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  40 
 
 
316 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  37.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  37.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  38.01 
 
 
314 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  43.23 
 
 
314 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.38 
 
 
300 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
312 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  39.2 
 
 
311 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.88 
 
 
312 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.42 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  38.32 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.76 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 
328 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
274 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.49 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.23 
 
 
316 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
306 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 
327 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  42.49 
 
 
335 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  40.28 
 
 
289 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 
306 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.52 
 
 
329 aa  192  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.95 
 
 
309 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  35.08 
 
 
360 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.65 
 
 
306 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  43.56 
 
 
306 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  40.99 
 
 
305 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.04 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
344 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.89 
 
 
279 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.38 
 
 
313 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  39.25 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  34.67 
 
 
337 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  43.04 
 
 
346 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  42.61 
 
 
346 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.64 
 
 
337 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
356 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  38.2 
 
 
310 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  42.61 
 
 
346 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  41.99 
 
 
317 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
369 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.64 
 
 
309 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  37.77 
 
 
318 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  43.48 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  42.79 
 
 
314 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  43.48 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  43.48 
 
 
318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
309 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 
322 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28400  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.74 
 
 
375 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
328 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1333  ABC transporter related  42.31 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.573564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  43.04 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.11 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.13 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  34.66 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.46 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.44 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  39.74 
 
 
244 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  40.08 
 
 
303 aa  183  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
305 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.13 
 
 
307 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.91 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  29.97 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  36.62 
 
 
311 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 
245 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.74 
 
 
315 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.06 
 
 
298 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  30.34 
 
 
325 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.34 
 
 
315 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.31 
 
 
326 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
321 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 
279 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  39.44 
 
 
308 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  33.33 
 
 
316 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.78 
 
 
327 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  32.52 
 
 
310 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
314 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  39.73 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.64 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  39.74 
 
 
244 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>