More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3515 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  634    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  48.68 
 
 
310 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
308 aa  292  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  44.27 
 
 
328 aa  287  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  44.44 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
321 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  42.67 
 
 
319 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  44.26 
 
 
316 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  42.9 
 
 
317 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  41 
 
 
309 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  42.24 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
308 aa  252  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  42.39 
 
 
316 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  39.67 
 
 
311 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  38.87 
 
 
316 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  38.33 
 
 
316 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  38.33 
 
 
316 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  38.49 
 
 
316 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
360 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.49 
 
 
316 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.99 
 
 
311 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
312 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  32.05 
 
 
319 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.31 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  34.43 
 
 
335 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.88 
 
 
314 aa  188  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
312 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.95 
 
 
317 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  32.67 
 
 
301 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 
312 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.43 
 
 
308 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.46 
 
 
312 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  32.57 
 
 
310 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  32.89 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.01 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.11 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  34.45 
 
 
300 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.95 
 
 
327 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.78 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
350 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  35.47 
 
 
307 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  30.87 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  31.35 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
301 aa  178  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.22 
 
 
299 aa  179  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.15 
 
 
305 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.63 
 
 
312 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 
245 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 
301 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  31.76 
 
 
308 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  30.13 
 
 
331 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  30.52 
 
 
329 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.68 
 
 
305 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  30.72 
 
 
308 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.24 
 
 
312 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 
303 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
309 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  32.79 
 
 
319 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.68 
 
 
305 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  31.8 
 
 
303 aa  175  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.13 
 
 
298 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  33.11 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.32 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  30.1 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  33.89 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  33.89 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  30.1 
 
 
320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  35.59 
 
 
237 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.92 
 
 
335 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.28 
 
 
279 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.45 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  41.47 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.58 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
252 aa  172  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  40 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
306 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  29.71 
 
 
323 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.36 
 
 
315 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.8 
 
 
297 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  33.86 
 
 
257 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  31.02 
 
 
305 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
336 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.58 
 
 
339 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.17 
 
 
328 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.1 
 
 
314 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.44 
 
 
259 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
344 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.52 
 
 
293 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>