More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0418 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  617  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  54.63 
 
 
350 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  51.31 
 
 
344 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0552  ABC transporter related  54.9 
 
 
320 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.652365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
279 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  48.85 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28400  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.38 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.57 
 
 
337 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  38.36 
 
 
309 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.62 
 
 
306 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.03 
 
 
319 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
308 aa  189  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
308 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.25 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  44.55 
 
 
328 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.29 
 
 
305 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  37.13 
 
 
316 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  35.86 
 
 
311 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  34.21 
 
 
310 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.12 
 
 
337 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  31.76 
 
 
316 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  31.76 
 
 
316 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  31.39 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  33.11 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.01 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  35.47 
 
 
313 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  30.65 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
309 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  34.29 
 
 
335 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.65 
 
 
317 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  32.49 
 
 
316 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.55 
 
 
316 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.9 
 
 
255 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  33.77 
 
 
299 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
318 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  31.45 
 
 
316 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  31.56 
 
 
316 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.15 
 
 
303 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  31.54 
 
 
303 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 
303 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.44 
 
 
305 aa  155  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.1 
 
 
335 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.48 
 
 
299 aa  155  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.54 
 
 
307 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.75 
 
 
310 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  32.13 
 
 
305 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  35.56 
 
 
512 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  30.13 
 
 
306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.91 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  42.36 
 
 
583 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.69 
 
 
430 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  31.19 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.11 
 
 
301 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
411 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.05 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  30.95 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
351 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
360 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.91 
 
 
307 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  31.46 
 
 
305 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  31.09 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  43.96 
 
 
313 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 
332 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  33.05 
 
 
289 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.13 
 
 
340 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.6 
 
 
309 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35 
 
 
315 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  40.74 
 
 
283 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  36.56 
 
 
339 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  32.76 
 
 
235 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.24 
 
 
240 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  36.73 
 
 
310 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.58 
 
 
315 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  36.73 
 
 
310 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  38.86 
 
 
317 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
309 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
309 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  31.25 
 
 
298 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
309 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.56 
 
 
308 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
309 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
309 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.71 
 
 
314 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  32.78 
 
 
314 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  37.91 
 
 
316 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
309 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.05 
 
 
321 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  37.16 
 
 
306 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.71 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  30.82 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.04 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  42.36 
 
 
582 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  32.11 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>