More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2132 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
247 aa  244  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  48.35 
 
 
247 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  44.96 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  42.02 
 
 
257 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  41.74 
 
 
247 aa  218  7e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  42.92 
 
 
250 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  42.92 
 
 
250 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 
242 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  40.33 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 
241 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  41.39 
 
 
246 aa  209  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
241 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
244 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
252 aa  207  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  38.84 
 
 
241 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  40.5 
 
 
241 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
241 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.79 
 
 
316 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  39.83 
 
 
240 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.05 
 
 
310 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  42.45 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  38.84 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  39.08 
 
 
249 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 
305 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  40.41 
 
 
252 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  41.44 
 
 
337 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  41.22 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
312 aa  195  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
244 aa  194  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.78 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  40.09 
 
 
316 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
309 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.89 
 
 
316 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
238 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  40.79 
 
 
332 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
259 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
369 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.92 
 
 
512 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  46.58 
 
 
332 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.59 
 
 
249 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 
255 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  40.09 
 
 
328 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  41.63 
 
 
270 aa  186  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  42.62 
 
 
253 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
261 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
249 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  40.34 
 
 
309 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  41.42 
 
 
324 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  38.43 
 
 
237 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.97 
 
 
243 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  37.97 
 
 
238 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
305 aa  185  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
309 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
321 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
274 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
327 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  38.33 
 
 
246 aa  185  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 
238 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  36.29 
 
 
414 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.13 
 
 
411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  41.1 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  40.33 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  41.71 
 
 
318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.62 
 
 
315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.34 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.26 
 
 
337 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.51 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
356 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  38.52 
 
 
266 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 
255 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 
318 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.09 
 
 
344 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.75 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  41.85 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
243 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.08 
 
 
313 aa  181  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  40.09 
 
 
338 aa  181  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.33 
 
 
325 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  39 
 
 
510 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.89 
 
 
328 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
308 aa  181  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.08 
 
 
313 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 
320 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  37.66 
 
 
317 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
318 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  40.83 
 
 
252 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  39.37 
 
 
319 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>