More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1421 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  100 
 
 		 317 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  91.19 
 
 		 318 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  91.19 
 
 		 318 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  91.19 
 
 		 318 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  90.57 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  90.4 
 
 		 346 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  90.67 
 
 		 346 aa  567  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  90.03 
 
 		 346 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  74.13 
 
 		 322 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  66.67 
 
 		 313 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  66 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  62.09 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  60.53 
 
 		 308 aa  394  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  60 
 
 		 322 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  60.46 
 
 		 323 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.53 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  58.06 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  59.21 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  54.79 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  56.62 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.17 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.34 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  45.51 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.48 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  45.79 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  43.93 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  43.93 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  45.3 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  44.12 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  47.89 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  45.27 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  44.78 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  44.07 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  42.72 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.35 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  44.23 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.35 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  44.08 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  43.63 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.59 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.05 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.94 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  40.67 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  46.31 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  48.31 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  40.33 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.39 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  44.44 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  39.14 
 
 		 324 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.77 
 
 		 510 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.72 
 
 		 319 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  44.05 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.72 
 
 		 319 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40.51 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  48.39 
 
 		 512 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  48.64 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.87 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47.14 
 
 		 576 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.82 
 
 		 667 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  46.52 
 
 		 904 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  49.76 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  43.2 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  41.75 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 583 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 589 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  42.18 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  38.59 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  48.64 
 
 		 588 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.5 
 
 		 580 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.64 
 
 		 580 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 576 aa  212  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  45.3 
 
 		 932 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  39.12 
 
 		 354 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  46.67 
 
 		 599 aa  212  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  44.04 
 
 		 580 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  41.88 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  47.25 
 
 		 593 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 580 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  40.33 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.27 
 
 		 581 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  44.55 
 
 		 579 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>